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アンプリコンシーケンス 1件
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海外提携先BMKGeneで実施。NovaSeq PE250、5万/10万/30万リードペアのプラン。料金は要問い合わせ。
全ゲノム解析(WGS) 1件
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海外提携先BMKGeneで解析。Illumina/BGI(PE150)、Nanopore、PacBio。ヒトは90 Gb。料金はお問い合わせ。QC合格後 約2〜2.5か月。
SNP解析 4件
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Infiniumアレイでゲノム全体のSNPを判定。ヒト・植物・動物のアレイ30種以上。海外提携先で実施。料金は要問い合わせ。
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MALDI-TOF-MSで最大40 SNPを同時に判定。10 SNP・1ウェル:46検体まで320,000円、94検体まで401,000円(税別)。米国CD Genomics社で実施。
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既製アッセイのないSNPをカスタム設計して判定。基本料金195,000円/1 SNP(250反応)+反応2,100円/検体(税別)。設計に4〜5週間。
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rs番号で選んだ既製のTaqManアッセイで判定。基本料金118,000円/1 SNP(250反応)+反応2,100円/検体(税別)。
核型解析(染色体検査) 2件
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ゲノムDNAを送るアレイ型。Gainは2 Mb超、Lossは1 Mb超、AOHは5 Mb超を検出。142,000円/サンプル(10サンプル以上・税別)。
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同じアレイ型の高解像度版。GainもLossも25〜50 kb超、AOHは1 Mb超まで見える。266,000円/サンプル(10サンプル以上・税別)。
コピー数解析(CNV) 4件
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CytoScan HD と同じ流れで、マーカー数を約75万に絞った廉価版。20〜24検体で99,000円/検体(税別)。
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ヒトのCNV解析用に作られたアレイで、約270万マーカーからゲノム全体のコピー数を見る。この分類で数少ない公開価格のひとつ。20〜24検体で142,000円/検体(税別)。
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FFPEの劣化したDNAでもゲノム全体のコピー数とLOHを見られるMIPアレイ。解像度は約50〜100 kbで、10コピーを超える増幅にも対応する。Plusのほうは9遺伝子74変異の体細胞変異も同時に見る。
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リアルタイムPCRで指定した領域のコピー数を調べる。組織・細胞・血液・体液からでも受け付ける。必要なDNA量はプローブ数と繰り返し回数から計算する式が公開されている。
ミトコンドリアDNA解析 1件
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組織や細胞からミトコンドリアDNAだけを選んで抽出してくれる。読むのは自分または別の会社、という組み合わせ方ができる。核ゲノムの混入を減らしたいときの前処理。15,000円/検体(税別)、4検体以上。
プロテオーム解析(網羅・定量) 5件
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timsTOF によるイオンモビリティ併用の4D-DIAで、6,000〜8,000タンパク質を同定・相対定量する。海外(Creative Proteomics社・アメリカ)で解析。158,000円/検体(税別)、海...
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同じ4D-DIAの高深度メニュー。8,000〜10,000タンパク質。190,000円/検体(税別)、海外輸送費別途。
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TMT試薬で印をつけ、最大18-plex でまとめて測る。海外(Creative Proteomics社)で解析。精製タンパク質は >300 µg。220,000円/検体(税別)、2サンプル以上から。
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iTRAQ試薬で印をつけ、最大8-plex でまとめて測る。海外(Creative Proteomics社)で解析。220,000円/検体(税別)、2サンプル以上から。
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標識せずにDDAで測り、検体をまたいで相対定量する。海外(Creative Proteomics社)で解析。推奨 >150 µg、最低 >50 µg。3サンプル以上から。価格は公開されていない。
タンパク質同定 2件
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SDS-PAGEのバンドや2次元ゲルのスポットを、海外の業務提携先(MS Bioworks)で LC/MS/MS 同定する。単一タンパク質で1 ng以上から。約1〜1.5か月。価格は公開されていない。
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組換え・精製タンパク質の溶液を、海外の業務提携先(MS Bioworks)で LC/MS/MS 同定する。総タンパク質濃度1 µg/µL で10 µL以上から。約1〜1.5か月。価格は公開されていない。
リン酸化解析 2件
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※Biognosys 実施
スイスのDIAプロテオミクス専門会社。今回調べたなかで深度が飛び抜けていて、1試験あたり25,000〜65,000のclass Iリン酸化ペプチドを定量すると公開している。ラベルフリーのDIAで、解析はPTM専用ワ...
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※Creative Proteomics 実施
濃縮をIMAC、TiO2、リン酸化チロシン抗体から選べるのが特徴で、チロシンのリン酸化のように量が少ないものを狙うときに効く。対象はセリン・スレオニン・チロシン。装置はTriple TOF 5600、Q Exact...
ユビキチン化解析 2件
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※Sciomics 実施
1,438種類のタンパク質について、発現量とユビキチン化の状態を同時にプロファイリングする抗体アレイ。質量分析と違って部位は分からないが、少ない試料で群間比較ができる。培養細胞と組織に対応し、血清・血漿は対象外。最...
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※Creative Proteomics 実施
anti-diGly抗体で濃縮し、高分解能LC-MS/MSで1実験あたり5,000〜15,000のユビキチン化部位を2,000〜5,000のタンパク質から同定する。必要なタンパク質量は、網羅的な解析で1検体10〜2...
タンパク質間相互作用解析 3件
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※Creative Proteomics 実施
タンパク質複合体をアフィニティで精製し、高分解能LC-MS/MSで相手を同定する。FLAG、HA、His、Mycなどのタグに対応し、質の高い抗体を使えばタグなしでも受けられる。必要なのは培養細胞が1レプリケートあた...
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※Creative Proteomics 実施
抗体、バッファー、ビーズの条件を詰めたうえで共免疫沈降を行い、SDS-PAGEとウェスタンブロットで複合体を確かめる。質量分析を組み合わせれば相手の同定と定量までできる。必要な試料は種類ごとに公開されていて、細胞ラ...
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※Creative Proteomics 実施
生きた細胞の中で、ベイトの近くにあるタンパク質にビオチンの目印を付け、ストレプトアビジンで回収してLC-MS/MSで読む。弱い相互作用、一瞬だけの相互作用、細胞内の区画ごとのタンパク質の顔ぶれ、薬を入れたときの変化...
レクチンアレイ解析 2件
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70種のレクチンを載せたアレイで糖鎖プロファイルを比べる。価格が公開されていて、14検体930,000円、28検体1,667,000円、56検体3,215,000円(いずれも税別)。検体ごとではなく「○検体までのセ...
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レクチンの数を95種に増やしたアレイ。網羅性では今回のなかで最も高い。12検体1,260,000円、24検体2,326,000円、48検体4,282,000円(いずれも税別)で、検体数の刻みが70種のものと違う(1...
糖鎖アレイ解析 2件
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機能的な結合が報告されている合成糖鎖100種を載せたガラススライドアレイ。国内で実施され、価格が公開されている数少ないサービスで、4サンプル540,000円(税別)。レプリケート数は4と多い。試料をビオチン標識して...
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糖鎖の数を300種に増やしたアレイ。網羅性では今回のなかで国内最大。4サンプル866,000円(税別)で、1サンプルあたり216,500円。100種のアレイ(135,000円/サンプル)の1.6倍ほどになる。レプリ...
メタボローム解析 3件
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※Creative Proteomics 実施
安定同位体でラベルした基質を細胞に取り込ませ、質量同位体分布から反応ごとの速度(フラックス値)を推定する。定常状態の13C-MFAに加えて、同位体非定常のINST-MFAにも対応する。トレーサーは13C-グルコース...
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LC-MSによるラベルフリーの網羅解析。最大700の同定代謝物に加えて200〜300の未知化合物まで報告する。84,000円/検体、3サンプルから。統計解析は別料金で174,000円/比較。米国で実施し、海外輸送費は別。
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FIA-QTOF-MS(フローインジェクション質量分析)でクロマト分離をせずに流し込み、血漿で1,200種類程度の代謝物をアノテーションする。10サンプル550,000円(税別・単価55,000円)、血清・血漿50...
リピドミクス 3件
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エクソソーム(細胞外小胞)に含まれる脂質を測る。単離済みエクソソームなら5×10^9〜1×10^10個以上、血漿なら2 mL以上から。抽出された脂質重量に対して正規化した濃度情報を報告する。3サンプルから。価格は要...
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LC-MSによる網羅的な脂質解析。最大400の同定された脂質種を、ピークの高さによる相対強度で報告する。103,000円/サンプル、3サンプルから。統計解析は別料金で174,000円/比較。米国で実施し、海外輸送費は別。
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目的の脂質パネルを選んで測る標的解析。脂肪酸はGC-MS、リン脂質はLC-MSを使う。脂肪酸パネル(総・遊離)は35項目、リン脂質パネルは100種類以上。1サンプルから(パネルによっては最低受付数の指定あり)。価格...
有機酸分析 1件
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有機酸27種のパネルを、GC-MSやLC-MSなど標的物質に合わせたプラットフォームで定量する。TCA回路、短鎖脂肪酸、芳香族や植物由来の酸(桂皮酸・フェルラ酸・シキミ酸など)まで対象が広い。既製パネルのほかカスタ...
電子顕微鏡観察(形態観察) 2件
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電解放出型走査電子顕微鏡JSM-6320Fなどで表面を撮影する。価格は倍率で決まり、1試料2視野で1万倍未満が22,000円、1〜3万倍未満が30,000円、3万倍以上が43,000円(いずれも税別)。SEM-ED...
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透過電子顕微鏡H-7600で内部の微細構造を撮影する。価格は倍率で決まり、1試料2視野で5万倍未満が30,000円、5〜10万倍未満が36,000円、10万倍以上が48,000円(いずれも税別)。固定・脱水36,0...
サイトカイン測定 2件
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MSDのMESO Quick SQ 120で、プレートの底に並べた抗体から電気化学発光を読む。V-PLEX(プレミックス・カスタム)、U-PLEX、S-PLEXのキットに対応する。必要な検体量は希釈倍率で変わり、2...
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納期を営業日で公開している数少ない受託で、試薬キットと検体の到着後15〜20営業日程度。いつ結果が返るか読めるので、学会や報告の日程が決まっているときに使いやすい。サンドイッチイムノアッセイ法で、スタンダードカーブ...
ELISA(免疫測定) 1件
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Simoa HD-X Analyzerで、従来のELISAより最大1,000倍の感度で測る。フェムトモーラーレベルまで届き、ダイナミックレンジは4桁を超える。マルチプレックスパネルを使えば最大4項目まで同時に測れる...
オミクスデータの統計解析・バイオマーカー探索 2件
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※Creative Proteomics 実施
タンパク質のアノテーションからGO/KEGGのエンリッチメント、クラスター解析、タンパク質間相互作用まで。1比較174,000円(税別)。1群3〜5検体。
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※Creative Proteomics 実施
PCA・PLS-DA・OPLS-DAからヒートマップ、相関ネットワーク、バイオマーカー探索まで。1比較174,000円(税別)。1群3検体以上が必要。