全ゲノム解析（WGS）受託サービス比較

ゲノム全体（ヒトなら約30億塩基）を読む解析です。

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全ゲノム解析（Whole Genome Sequencing, WGS）

エクソン以外の領域や、構造変異（SV）・コピー数の変化（CNV）も調べられます。ヒトでは90 Gb（約30×）が目安です。動植物・微生物では、ゲノムの大きさで必要なデータ量が変わります。

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各社の公開情報から計算した参考価格です。正式な金額は各社の見積で確認してください。

税区分は各社の表記によります。「起点」は基本料金に含まれる最初の工程です（起点が違うと、同じ金額でも含まれる作業が違います）。料金を公開していない会社も「要見積」として並べています。表の見出しの文字を押すと、その列で並べ替えられます（もう一度押すと逆の順）。記載なしは、いつも最後に並びます。

登録企業は、受託解析Quick 上で見積に直接回答します（未登録の会社にも依頼できます）。

表は左右にスクロールして詳細を比較できます。

会社・サービス	ランキング ▼	参考合計（6検体）	基本料金（単価）	製品の特徴	最低検体数	起点	対象生物	リードの種類	データ量	ライブラリ	変異検出（SNV・InDel）	構造変異・コピー数（SV・CNV）	納期
bitBiome 全ゲノム解析（微生物株）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	1	¥180,000 税抜	¥30,000/検体	1 細菌・真菌などの菌株が対象 2 DNA抽出からシーケンス・解析まで 3 ドラフトゲノムとアノテーションつき	記載なし	組織・血液・菌体などから（DNA抽出を含む）	微生物	ショートリード（Illumina など）	0.3 Gb／検体	記載なし	オプション（別料金）	記載なし	6週（標準納期）
Gene Nex 動植物ゲノムシーケンス（WGS・解析なし）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	2	¥300,000 税抜	¥50,000/検体	1 動植物のゲノムが対象 2 PE150・10 Gbaseでデータ量は指定可 3 QC後15営業日	記載なし	DNAから	動物・植物	ショートリード（Illumina など）	10 Gb／検体	PCR-free・PCRありを選べる	記載なし	記載なし	15営業日（QC後から15営業日）
Gene Nex 動植物ゲノムシーケンス（WGS・解析あり）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	3	¥420,000 税抜	¥70,000/検体	1 レファレンスのある生物が対象 2 SNP・InDelの変異解析つき 3 PE150で10 Gbase、QC後30営業日	記載なし	DNAから	動物・植物	ショートリード（Illumina など）	10 Gb／検体	PCR-free・PCRありを選べる	料金に含む	記載なし	30営業日（QC後から30営業日）
コスモ・バイオ全ゲノムシーケンシング 45 Gb（マクロジェン・ジャパン実施）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	4	¥474,000 税抜	¥79,000/検体	1 全生物が対象 2 NovaSeq X Plusで150 bp・45 Gb 3 QC合格後4〜6週間	記載なし	DNAから	生物種を問わない	ショートリード（Illumina など）	45 Gb／検体	PCR-free・PCRありを選べる	オプション（別料金）	オプション（別料金）	4〜6週（QC合格後）
コスモ・バイオ全ゲノムシーケンシング 90 Gb（マクロジェン・ジャパン実施）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	5	¥582,000 税抜	¥97,000/検体	1 全生物が対象 2 NovaSeq X Plusで150 bp・90 Gb 3 QC合格後4〜6週間	記載なし	DNAから	生物種を問わない	ショートリード（Illumina など）	90 Gb／検体	PCR-free・PCRありを選べる	オプション（別料金）	オプション（別料金）	4〜6週（QC合格後）
富士フイルム和光純薬全ゲノムシーケンス 90 Gb（Veritas Genetics）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	6	¥660,000 税抜	¥110,000/検体	1 Veritas社（中国）で実施 2 NovaSeq X Plusで90 Gbを読む 3 ラボ到着後20〜25営業日	記載なし	DNAから	記載なし	ショートリード（Illumina など）	90 Gb／検体	記載なし	記載なし	記載なし	20〜25営業日（Veritas社ラボ（中国）に到着後。発送に別途2〜3週間）
Gene Nex ヒト全ゲノムシーケンス（WGS・解析なし）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	7	¥780,000 税抜	¥130,000/検体	1 PE150で90 Gbaseを読む 2 Q30＞80%を保証する 3 QC後15営業日	記載なし	DNAから	ヒト	ショートリード（Illumina など）	90 Gb／検体	PCR-free・PCRありを選べる	記載なし	記載なし	15営業日（QC後から15営業日）
タカラバイオヒト全ゲノムシーケンス解析（ショートリード）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	8	¥900,000 税区分：一部記載なし	¥150,000/検体	1 NovaSeqとPCR-freeライブラリで読む 2 1検体90 Gbase 3 変異解析はオプション	記載なし	DNAから	ヒト・マウス	ショートリード（Illumina など）	90 Gb／検体	PCR-free	オプション（別料金）	オプション（別料金）	4週（約4週間〜。変異解析オプションは約10営業日追加）
Gene Nex ヒト全ゲノムシーケンス（WGS・解析あり）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	8	¥900,000 税抜	¥150,000/検体	1 PE150で90 Gbaseを読む 2 SNP・InDel・SV・CNVの検出つき 3 アノテーションまで含む、QC後25営業日	記載なし	DNAから	ヒト	ショートリード（Illumina など）	90 Gb／検体	PCR-free・PCRありを選べる	料金に含む	料金に含む	25営業日（QC後から25営業日）
bitBiome ロングリード全ゲノム解析（微生物株）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	8	¥900,000 税抜	¥150,000/検体	1 PacBio Revioで微生物株の全ゲノム 2 完全長ゲノムの組み立てに向く 3 DNA抽出からデータ解析まで	記載なし	組織・血液・菌体などから（DNA抽出を含む）	微生物	ロングリード（PacBio HiFi）	0.3 Gb／検体	ロングリード用	オプション（別料金）	記載なし	8週（標準納期）
富士フイルム和光純薬全ゲノムシーケンス（AnnoRoad・ヒト）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	11	¥1,020,000 税抜	1〜4検体：¥178,000/検体 5〜9検体：¥170,000/検体 10検体以上：¥160,000/検体	1 AnnoRoad社（中国）のヒト全ゲノム 2 150 bp PEで90 G、30×相当 3 ラボ到着後20営業日〜	1検体から	DNAから	ヒト	ショートリード（Illumina など）	90 Gb／検体	記載なし	記載なし	記載なし	20営業日（AnnoRoad社にサンプル到着後20営業日〜。検体の発送に別途2〜3週間）
富士フイルム和光純薬全ゲノムシーケンス 270 Gb（Veritas Genetics）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	12	¥1,800,000 税抜	¥300,000/検体	1 Veritas社（中国）で実施 2 NovaSeq X Plusで270 Gbを読む 3 ラボ到着後20〜25営業日	記載なし	DNAから	記載なし	ショートリード（Illumina など）	270 Gb／検体	記載なし	記載なし	記載なし	20〜25営業日（Veritas社ラボ（中国）に到着後。発送に別途2〜3週間）
bitBiome ロングリード全ゲノム解析（真核生物）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	13	¥2,100,000 税抜	¥350,000/検体	1 PacBio Revioで読む 2 DNA抽出とアノテーションまで込み 3 1セルで50〜90 Gb	記載なし	組織・血液・菌体などから（DNA抽出を含む）	ヒト・動物・植物	ロングリード（PacBio HiFi）	5 Gb／検体	ロングリード用	記載なし	記載なし	8週（標準納期）
マクロジェン・ジャパン Whole Genome Sequence（WGS）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 NovaSeq X PlusとPacBio Revioに対応 2 SNP/Indel・SV・CNV・de novoを選べる 3 Raw data納品まで平均1〜1.5か月	記載なし	DNAから	ヒト・微生物	ショートリード（Illumina など）・ロングリード（PacBio HiFi）	記載なし	PCR-free・PCRありを選べる	オプション（別料金）	オプション（別料金）	1〜1.5か月（サンプル到着からRaw data納品まで平均）
北海道システム・サイエンスヒトゲノム解析（全ゲノム・WGS）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 ヒトの全ゲノム90 Gb（×30） 2 PCR-Plus 500ng〜、PCR-Free 4µg〜 3 SNP・InDel・SV・CNVの変異候補を検索	記載なし	DNAから	ヒト	ショートリード（Illumina など）	90 Gb／検体	PCR-free・PCRありを選べる	記載なし	記載なし	記載なし
北海道システム・サイエンスゲノムリシーケンス解析（ヒト以外）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 ヒト以外の生物が対象 2 参照ゲノムを使った全ゲノム解析 3 Illumina 150PEで×30以上を推奨	記載なし	DNAから	動物・植物・微生物	ショートリード（Illumina など）	記載なし	PCR-free・PCRありを選べる	記載なし	記載なし	記載なし
ノボジーン動植物全ゲノムシーケンス（PAWGS）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 動物・植物の全ゲノムが対象 2 NovaSeq・PacBio・Nanoporeに対応 3 Q30は85%以上	記載なし	DNAから	動物・植物	ショートリード（Illumina など）・ロングリード（PacBio HiFi）・ロングリード（Nanopore）	記載なし	PCR-free・PCRありを選べる	記載なし	記載なし	記載なし
Rhelixa WGS（全ゲノムシーケンス）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 ヒト90 Gb、細菌・真菌1 Gbの例 2 生データからオーダーメイドまでのプラン 3 4〜7週、解析込みで6〜9週	記載なし	DNAから	ヒト・微生物	ショートリード（Illumina など）	記載なし	記載なし	記載なし	記載なし	4〜7週（シーケンスのみ4〜7週、解析を含むと6〜9週）
GENEWIZ（アゼンタ）全ゲノムシーケンシング（WGS）公式サイト情報確認日： 2026-09-29 直接取引のみ	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 植物・動物・細菌・ウイルスまで対応 2 Illumina・PacBio・Nanoporeに対応 3 サンプル調製から解析まで	記載なし	DNAから	ヒト・動物・植物・微生物	ショートリード（Illumina など）・ロングリード（PacBio HiFi）・ロングリード（Nanopore）	記載なし	PCR-free・PCRありを選べる	記載なし	記載なし	記載なし
フィルジェンヒト・動植物全ゲノムシークエンス（BMKGene）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 提携先BMKGeneで解析する 2 Illumina・Nanopore・PacBioに対応 3 ヒトは90 Gb、QC合格後約2〜2.5か月	記載なし	DNAから	ヒト・動物・植物	ショートリード（Illumina など）・ロングリード（PacBio HiFi）・ロングリード（Nanopore）	90 Gb／検体	記載なし	記載なし	記載なし	2〜2.5か月（バイオインフォマティクス解析付は約2.5〜3か月）
bitBiome 全ゲノム解析（真核生物・ショートリード）公式サイト情報確認日： 2026-09-29	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 真核生物のショートリード全ゲノム 2 ドラフトゲノムとアノテーションを含む 3 DNA抽出は含まない	記載なし	DNAから	ヒト・動物・植物	ショートリード（Illumina など）	記載なし	記載なし	記載なし	記載なし	6週（標準納期）
理研ジェネシスヒト全ゲノム解析公式サイト情報確認日： 2026-09-29	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 NovaSeq X PlusとNovaSeq 6000に対応 2 SNV・Short InDel・構造変異を同定 3 解析報告書とデータHDDを納品	記載なし	DNAから	ヒト	ショートリード（Illumina など）	90 Gb／検体	PCRあり	料金に含む	料金に含む	記載なし

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