SERVICE DETAILS
マクロジェン・ジャパン： Whole Genome Sequence（WGS）
マクロジェン・ジャパンが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方：
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
NovaSeq X Plus（150 bp）と PacBio Revio（平均10〜20 kb）。マッピング・SNP/Indel・SV・CNV・de novo解析を選べる。料金はお問い合わせ。Raw data納品まで平均1〜1.5か月。
参考合計 （6検体）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積（基本料金が非公開）
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 （必須） | 基本料金 | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | Whole Genome Sequence (WGS) （公式） | お問い合わせ（金額は公開されていない） |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
全ゲノム解析（Whole Genome Sequencing, WGS）
ゲノム全体（ヒトなら約30億塩基）を読む解析です。エクソン以外の領域や、構造変異（SV）・コピー数の変化（CNV）も調べられます。ヒトでは90 Gb（約30×）が目安です。動植物・微生物では、ゲノムの大きさで必要なデータ量が変わります。
| 基本料金の起点 | DNAから 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 対象と読み方 | |
| 対象生物 | ヒト・微生物 |
| 対象生物の補足 | ページのプラン例：ヒト（90 Gb/sample）、バクテリア（0.2 Gb/sample 目安） |
| リードの種類 ショートリードは1塩基の変異に強く、ロングリードは大きな構造変異・繰り返し配列・ゲノムの組み立てに強い | ショートリード（Illumina など）・ロングリード（PacBio HiFi） |
| シーケンサー | NovaSeq X Plus（Illumina）、PacBio Revio |
| ライブラリ PCR-free は増幅の偏りが少ないが、多くのDNAが必要 | PCR-free・PCRありを選べる |
| ライブラリの補足 | TruSeq DNA PCR-free／TruSeq Nano DNA（少ないDNA量でも可）／SMRTbell prep kit 3.0 |
| データ量 | |
| データ量 1検体あたりの読んだ塩基の量（10億塩基単位）。ヒトの90 Gbは約30× | 記載なし |
| カバレッジ ゲノムの同じ場所を平均何回読むか | 記載なし |
| リード長 ショートリードの1本の長さ（PE150なら150） | 150 bp |
| ペアエンド／シングルエンド | 記載なし |
| データ品質の基準 | 記載なし |
| データ量の補足 | プラン例：ヒト 90 Gb/sample、バクテリア 0.2 Gb/sample（目安）。PacBio Revio は最大25 kb（平均10〜20 kb） |
| 検体 | |
| 必要DNA量 | 記載なし |
| 必要な濃度 | 記載なし |
| 必要な液量 | 記載なし |
| 品質の条件 | 記載なし |
| DNAでの受付 | 受け付ける |
| FFPEでの受付 ホルマリン固定・パラフィン包埋の組織から取ったDNA | 記載なし |
| 菌株・菌体での受付 | 記載なし |
| DNA抽出 | 記載なし |
| 検体の補足 | 記載なし |
| 解析と納品 | |
| 変異検出（SNV・InDel） SNV＝1塩基の置き換わり、InDel＝短い挿入・欠失 | オプション（別料金） |
| 構造変異・コピー数（SV・CNV） SV＝大きな欠失・重複・逆位など、CNV＝遺伝子の数の増減 | オプション（別料金） |
| ゲノムの組み立て（de novo） 参照ゲノムのない生物で、読んだ配列からゲノムを組み立てる | オプション・別サービス |
| 納品ファイル FASTQ＝読んだ配列、BAM＝参照配列に並べたもの、VCF＝見つかった変異の一覧 | BAM・VCF |
| 納品方法 | Raw dataのほか、解析結果を納品。データ量が多い場合はHDD納品。ダウンロード納品もあり |
| 解析の補足 | 解析メニュー：マッピング、SNP/Indel、SV（構造多型）、CNV（コピー数多型）、De novo解析。解析結果は bam・vcf・xlsx |
| 納期と解析場所 | |
| 納期 | 1〜1.5か月（サンプル到着からRaw data納品まで平均） |
| 解析を行う場所 | 記載なし |
| 解析場所の補足 | 記載なし |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-09-29
