SERVICE DETAILS
bitBiome: ロングリード全ゲノム解析(微生物株)
bitBiomeが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方:
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
PacBio Revioで微生物株の全ゲノム(完全長ゲノムの組み立てに向く)。DNA抽出〜データ解析まで。0.3 Gb 150,000円〜(税抜)、8週間。
参考合計 (6検体)
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
¥900,000
| 内訳 | 単価 | 数量 | 小計 | 税 | 価格の出典 |
|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 データ量 0.3 Gb(LGS-001) | ¥150,000/検体 | 6 | ¥900,000 | 税抜 | ロングリード全ゲノム解析(微生物株) (公式) |
登録されている料金(すべて)
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 (必須) | データ量 0.3 Gb(LGS-001) | ¥150,000/検体 | — | 税抜 | 通常 | ロングリード全ゲノム解析(微生物株) (公式) | |
| その他オプション | データ量 1 Gb(LGS-002・0.3 Gbの料金の代わり) | ¥210,000/検体 | — | 税抜 | 通常 | ロングリード全ゲノム解析(微生物株) (公式) | 1検体。0.3 Gb(150,000円)の代わりにこの料金 |
| その他オプション | データ量 5 Gb(LGS-003・0.3 Gbの料金の代わり) | ¥350,000/検体 | — | 税抜 | 通常 | ロングリード全ゲノム解析(微生物株) (公式) | 1検体。0.3 Gb(150,000円)の代わりにこの料金 |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
全ゲノム解析(Whole Genome Sequencing, WGS)
ゲノム全体(ヒトなら約30億塩基)を読む解析です。エクソン以外の領域や、構造変異(SV)・コピー数の変化(CNV)も調べられます。ヒトでは90 Gb(約30×)が目安です。動植物・微生物では、ゲノムの大きさで必要なデータ量が変わります。
| 基本料金の起点 | 組織・血液・菌体などから(DNA抽出を含む) 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 対象と読み方 | |
| 対象生物 | 微生物 |
| 対象生物の補足 | 原核生物・真核生物の微生物株 |
| リードの種類 ショートリードは1塩基の変異に強く、ロングリードは大きな構造変異・繰り返し配列・ゲノムの組み立てに強い | ロングリード(PacBio HiFi) |
| シーケンサー | PacBio Revio |
| ライブラリ PCR-free は増幅の偏りが少ないが、多くのDNAが必要 | ロングリード用 |
| ライブラリの補足 | 記載なし |
| データ量 | |
| データ量 1検体あたりの読んだ塩基の量(10億塩基単位)。ヒトの90 Gbは約30× | 0.3 Gb/検体 |
| カバレッジ ゲノムの同じ場所を平均何回読むか | 記載なし |
| リード長 ショートリードの1本の長さ(PE150なら150) | 記載なし |
| ペアエンド/シングルエンド | 記載なし |
| データ品質の基準 | 記載なし |
| データ量の補足 | 0.3 Gb・1 Gb・5 Gb から選ぶ。データ量はDNA品質・サンプルにより変わり、保証はない |
| 検体 | |
| 必要DNA量 | 1,500 ng |
| 必要な濃度 | 30 ng/µL |
| 必要な液量 | 50 µL |
| 品質の条件 | 記載なし |
| DNAでの受付 | 受け付ける |
| FFPEでの受付 ホルマリン固定・パラフィン包埋の組織から取ったDNA | 記載なし |
| 菌株・菌体での受付 | 受け付ける |
| DNA抽出 | 料金に含む |
| 検体の補足 | 微生物株:細胞数5×10⁹ cells(湿重量100 mg以上)。DNA:30 ng/µl以上を50 µl以上(総量1.5 µg以上) |
| 解析と納品 | |
| 変異検出(SNV・InDel) SNV=1塩基の置き換わり、InDel=短い挿入・欠失 | オプション(別料金) |
| 構造変異・コピー数(SV・CNV) SV=大きな欠失・重複・逆位など、CNV=遺伝子の数の増減 | 記載なし |
| ゲノムの組み立て(de novo) 参照ゲノムのない生物で、読んだ配列からゲノムを組み立てる | 料金に含む |
| 納品ファイル FASTQ=読んだ配列、BAM=参照配列に並べたもの、VCF=見つかった変異の一覧 | FASTQ・解析レポート・ゲノム配列(FASTA) |
| 納品方法 | 記載なし |
| 解析の補足 | 納品:シーケンスデータ(fastq)、解析レポート、遺伝子アノテーション表、ドラフトゲノム配列、遺伝子塩基配列・アミノ酸配列。オプション:系統樹、SNP/indel、耐性遺伝子など |
| 納期と解析場所 | |
| 納期 | 8週(標準納期) |
| 解析を行う場所 | 国内 |
| 解析場所の補足 | 記載なし |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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ロングリード全ゲノム解析(微生物株) (公式)確認日 2026-09-29