SERVICE DETAILS
ノボジーン: 動植物全ゲノムシーケンス(PAWGS)
ノボジーンが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方:
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
動物・植物の全ゲノム。NovaSeq(PE150)、PacBio(平均>15 kb)、Nanopore(平均>17 kb)。Q30≥85%。料金・納期はお問い合わせ。
参考合計 (6検体)
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積(基本料金が非公開)
登録されている料金(すべて)
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 (必須) | 基本料金 | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | 動植物全ゲノムシーケンス (PAWGS) (公式) | お問い合わせ(金額は公開されていない) |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
全ゲノム解析(Whole Genome Sequencing, WGS)
ゲノム全体(ヒトなら約30億塩基)を読む解析です。エクソン以外の領域や、構造変異(SV)・コピー数の変化(CNV)も調べられます。ヒトでは90 Gb(約30×)が目安です。動植物・微生物では、ゲノムの大きさで必要なデータ量が変わります。
| 基本料金の起点 | DNAから 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 対象と読み方 | |
| 対象生物 | 動物・植物 |
| 対象生物の補足 | 記載なし |
| リードの種類 ショートリードは1塩基の変異に強く、ロングリードは大きな構造変異・繰り返し配列・ゲノムの組み立てに強い | ショートリード(Illumina など)・ロングリード(PacBio HiFi)・ロングリード(Nanopore) |
| シーケンサー | Illumina NovaSeq X Plus/NovaSeq 6000、PacBio Revio/Sequel II/IIe、Nanopore PromethION |
| ライブラリ PCR-free は増幅の偏りが少ないが、多くのDNAが必要 | PCR-free・PCRありを選べる |
| ライブラリの補足 | 通常/PCR-free(350 bp・350 bp以外)/ロングリード用(HMW DNA) |
| データ量 | |
| データ量 1検体あたりの読んだ塩基の量(10億塩基単位)。ヒトの90 Gbは約30× | 記載なし |
| カバレッジ ゲノムの同じ場所を平均何回読むか | 記載なし |
| リード長 ショートリードの1本の長さ(PE150なら150) | 150 bp |
| ペアエンド/シングルエンド | ペアエンド |
| データ品質の基準 | Q30≥85% |
| データ量の補足 | 推奨デプス:SNP/InDel ≥10×、SV/CNV ≥20×。PacBio 平均>15 kb、Nanopore 平均>17 kb |
| 検体 | |
| 必要DNA量 | 200 ng |
| 必要な濃度 | 記載なし |
| 必要な液量 | 記載なし |
| 品質の条件 | A260/280=1.8-2.0、分解・コンタミなし |
| DNAでの受付 | 受け付ける |
| FFPEでの受付 ホルマリン固定・パラフィン包埋の組織から取ったDNA | 記載なし |
| 菌株・菌体での受付 | 記載なし |
| DNA抽出 | 記載なし |
| 検体の補足 | Illumina:≥200 ng(通常)、≥1.2 μg(PCR free・350 bp)、≥5 μg(PCR free・350 bp以外)。PacBio HiFi:HMW DNA ≥5 μg・断片≥30 kb。Nanopore:≥8 μg・断片≥30 kb(A260/230=1.5-2.6) |
| 解析と納品 | |
| 変異検出(SNV・InDel) SNV=1塩基の置き換わり、InDel=短い挿入・欠失 | 記載なし |
| 構造変異・コピー数(SV・CNV) SV=大きな欠失・重複・逆位など、CNV=遺伝子の数の増減 | 記載なし |
| ゲノムの組み立て(de novo) 参照ゲノムのない生物で、読んだ配列からゲノムを組み立てる | オプション・別サービス |
| 納品ファイル FASTQ=読んだ配列、BAM=参照配列に並べたもの、VCF=見つかった変異の一覧 | 記載なし |
| 納品方法 | 記載なし |
| 解析の補足 | 標準解析:データ品質管理、参照ゲノムへのアライメント、SNP検出・アノテーション。高度な解析:SV検出、CNV検出・アノテーション。de novo は別サービス |
| 納期と解析場所 | |
| 納期 | 記載なし |
| 解析を行う場所 | 記載なし |
| 解析場所の補足 | 記載なし |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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動植物全ゲノムシーケンス (PAWGS) (公式)確認日 2026-09-29