16S rRNA 菌叢解析 受託サービス比較

細菌がもつ16S rRNA遺伝子の一部(または全長)を増やして読み、試料の中にどんな細菌が、どのくらいの割合でいるか(菌叢)を調べる解析です。

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16S rRNA アンプリコンシーケンスによる菌叢解析(細菌叢解析)

腸内細菌・口腔・土壌・水などに使われます。

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各社の公開情報から計算した参考価格です。正式な金額は各社の見積で確認してください。
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サービス比較結果

条件に合う会社・サービス 29件表示(全29件中)

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見積 会社・サービス ランキング ▲ 参考合計(6検体) 基本料金(単価) 製品の特徴 最低検体数 起点 増幅する領域 リード数 シーケンサー DNA抽出 菌の分類(属・種の推定) 多様性解析(α・β) 納期
フナコシ ※Zymo Research 実施
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 PacBio Sequel IIeで16S全長
2 DADA2(ASV)で種レベルまで
記載なし 記載なし 全長(V1–V9) 記載なし PacBio Sequel IIe(SMRT Cell 8M) 対応あり(条件は相談) 料金に含む 料金に含む 3週(試料受領後、最短)
中外テクノス
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 試料を送るだけで前処理から解析まで
2 3万リード保証で5万リードが目安
記載なし 試料から(糞便・土壌などからのDNA抽出を含む) 記載なし 30,000 リード/検体 Illumina MiSeq 料金に含む 料金に含む オプション(別料金) 記載なし
GENEWIZ(アゼンタ)
情報確認日: 2026-09-27 直接取引のみ
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 PacBioで16S全長(V1–V9)を読む
2 6K HiFiリードが目安
3 国内で試料処理・解析は海外ラボ
記載なし DNAから 全長(V1–V9) 6,000 リード/検体 PacBio(機種の記載なし) 対応あり(条件は相談) 料金に含む 記載なし 20〜25営業日(核酸サンプルQCパス後から。海外ラボの場合は国際輸送(約5営業日)が加わる)
GENEWIZ(アゼンタ)
情報確認日: 2026-09-27 直接取引のみ
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 2×250 bpで40〜50kリードが目安
2 α/β多様性・LEfSeまで標準
3 国内で試料処理・解析は海外ラボ
記載なし DNAから V3–V4 40,000 リード/検体 イルミナ(機種の記載なし) 対応あり(条件は相談) 料金に含む 料金に含む 20〜25営業日(核酸サンプルQCパス後から。海外ラボの場合は国際輸送(約5営業日)が加わる)
理研ジェネシス
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 CJ Bioscience社の解析サービス
2 V3–V4をMiSeqで読む
3 EzBioCloudで結果を閲覧できる
記載なし DNAから V3–V4 20,000 リード/検体 MiSeq 記載なし 料金に含む 料金に含む 2.5か月(品質評価通過後)
ノボジーン
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 PacBio(SMRT)で16S全長
2 5,000または10,000クリーンCCSリード
記載なし 記載なし 全長(V1–V9) 5,000 リード/検体 PacBio(SMRT。機種の記載なし) 記載なし 料金に含む 記載なし 記載なし
ノボジーン
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 NovaSeq 6000で16S・18S・ITSを読む
2 V4やV3–V4などから選べる
3 50K〜500K raw tagsから選ぶ
記載なし DNAから V4・V3–V4・その他 50,000 リード/検体 Illumina NovaSeq 6000 記載なし 料金に含む 料金に含む 記載なし
マクロジェン・ジャパン
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 SMRTbell prep kit 3.0を使う
2 PacBio Revioで読む
記載なし DNAから 全長(V1–V9) 記載なし PacBio Revio 記載なし 記載なし 記載なし 1〜1.5か月(ページ全体の記載(Raw data納品まで平均))
マクロジェン・ジャパン
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 V3–V4を2×300 bpで読む
2 約10万リードがプラン例
記載なし DNAから V3–V4 100,000 リード/検体 MiSeq i100 記載なし 記載なし 記載なし 1〜1.5か月(サンプル到着からRaw data納品まで(平均))
北海道システム・サイエンス
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 V3–V4で古細菌向け・真菌ITS1も可
2 3〜5万リードペア
3 QIIME 2の標準解析つき
記載なし DNAから V3–V4 30,000 リード/検体 NextSeq・MiSeq 別料金 料金に含む 料金に含む 記載なし
ゲノムリード
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 16S全長を読み種レベルまで解析
記載なし 記載なし 全長(V1–V9) 記載なし ページに記載の機器:MiSeq・GridION(Nanopore) 別料金 料金に含む 記載なし 1〜2週
日本ジェネティクス
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 PacBio Revio(CCSモード)で読む
2 10K〜40Kリードの品番がある
記載なし DNAから 全長(V1–V9) 記載なし PacBio Revio(CCSモード) 記載なし オプション(別料金) オプション(別料金) 6週(サンプルQC後(解析なしの場合))
日本ジェネティクス
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 MiSeq i100で2×300 bp
2 10万リード/サンプル
3 ASV解析は別品番
記載なし 記載なし V3–V4 100,000 リード/検体 Illumina MiSeq i100 記載なし オプション(別料金) オプション(別料金) 記載なし
Rhelixa
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 生データプランと解析つきプランがある
2 ベーシックとスタンダードから選べる
記載なし 記載なし 記載なし 50,000 リード/検体 記載なし 別料金 オプション(別料金) オプション(別料金) 4〜6週(検体到着から(生データプランの注文例))
タカラバイオ
情報確認日: 2026-09-27
— 要見積(基本料金が非公開) 要見積
1 V3–V4領域を読む
2 人工16S配列を使った絶対定量がある
記載なし 記載なし V3–V4 記載なし イルミナ社の次世代シーケンサー(機種の記載なし) 対応あり(条件は相談) 料金に含む 料金に含む 記載なし
テクノスルガ・ラボ
情報確認日: 2026-09-27
— ¥270,000 税抜 1〜24検体:¥45,000/検体
25〜48検体:¥35,000/検体
49〜72検体:¥30,000/検体
73〜96検体:¥27,000/検体
97検体以上:¥24,000/検体
1 唾液・プラーク・皮膚や膣の拭取物を送る
2 DNA抽出から菌叢解析まで
1検体から 試料から(糞便・土壌などからのDNA抽出を含む) V3–V4 10,000 リード/検体 MiSeq(Illumina) 料金に含む 料金に含む 記載なし 27営業日(DNA解析 27営業日〜(RNA解析は32営業日〜))
bitBiome
情報確認日: 2026-09-27
— ¥210,000 税抜 1〜7検体:¥35,000/検体
8検体以上:¥24,000/検体
1 PacBio Revioで16S全長を読む
2 DNA抽出と基本データ解析を含む
1検体から 試料から(糞便・土壌などからのDNA抽出を含む) 全長(V1–V9) 30,000 リード/検体 PacBio Revio 料金に含む 料金に含む 料金に含む 8週(標準納期)
テクノスルガ・ラボ
情報確認日: 2026-09-27
— ¥192,000 税抜 1〜24検体:¥32,000/検体
25〜48検体:¥25,000/検体
49〜72検体:¥22,000/検体
73〜96検体:¥20,000/検体
97検体以上:¥18,000/検体
1 糞便・腸管内容物・ルーメン液を送る
2 DNA抽出から菌叢解析まで
1検体から 試料から(糞便・土壌などからのDNA抽出を含む) V3–V4 10,000 リード/検体 MiSeq(Illumina) 料金に含む 料金に含む 記載なし 24営業日(DNA解析 24営業日〜(RNA解析は29営業日〜))
バリノス
情報確認日: 2026-09-27
— ¥180,000 税抜 ¥30,000/検体
1 子宮・腟・口腔など菌の少ない検体向け
2 V1–V2で種レベルまで
3 20営業日
記載なし 試料から(糞便・土壌などからのDNA抽出を含む) V1–V2 記載なし 記載なし 料金に含む 料金に含む オプション(別料金) 20営業日(検体受領から)
bitBiome
情報確認日: 2026-09-27
— ¥120,000 税抜 1〜7検体:¥20,000/検体
8検体以上:¥15,000/検体
1 3〜6万リード
2 QIIME 2で菌叢プロファイルまで
3 α・β多様性まで出す
1検体から 記載なし V3–V4 30,000 リード/検体 記載なし 対応あり(条件は相談) 料金に含む 料金に含む 6〜8週(標準納期)
テクノスルガ・ラボ
情報確認日: 2026-09-28
— ¥114,000 税抜 1検体以上:¥19,000/検体
1 食品・活性汚泥・土壌・環境水から頼める
2 1検体から受け付ける
3 FASTQのみでも頼める
1検体から 試料から(糞便・土壌などからのDNA抽出を含む) V1–V2・V3–V4・その他 30,000 リード/検体 MiSeq i100シリーズ(Illumina) 料金に含む 料金に含む オプション(別料金) 24営業日(検体から 24営業日〜)
プリメディカ
情報確認日: 2026-09-27
— ¥90,000 税抜 1検体以上:¥15,000/検体
1 糞便(ヒト・マウス・ブタ・ウシ)から
2 V3–V4で35営業日
1検体から 試料から(糞便・土壌などからのDNA抽出を含む) V3–V4 記載なし MiSeq(Illumina) 記載なし 料金に含む 料金に含む 35営業日(検体受領から)
テクノスルガ・ラボ
情報確認日: 2026-09-28
— ¥72,000 税抜 1検体以上:¥12,000/検体
1 DNA抽出物を送る
2 1検体から受け付ける
3 FASTQのみでも頼める
1検体から DNAから V1–V2・V3–V4・その他 30,000 リード/検体 MiSeq i100シリーズ(Illumina) 行っていない 料金に含む オプション(別料金) 18営業日(DNAから 18営業日〜)
FASMAC
情報確認日: 2026-09-27
— ¥70,000 税区分:一部記載なし 1〜8検体:¥70,000/一式
9〜16検体:¥125,000/一式
1 混合済みライブラリを送付
2 DNA抽出・PCRからはオプション
1検体から 調製済みライブラリから(シーケンスのみ) V3–V4 記載なし Illumina MiSeq i100 Plus 別料金 料金に含む オプション(別料金) 10〜15営業日(QC・シーケンス・QIIME 2標準解析のみの場合)
生物技研 登録企業
情報確認日: 2026-09-27
— ¥156,000 税抜 1〜7検体:¥26,000/検体
8〜23検体:¥21,000/検体
24〜31検体:¥19,000/検体
32〜39検体:¥18,000/検体
40〜47検体:¥17,000/検体
48〜55検体:¥16,000/検体
56〜63検体:¥15,000/検体
64〜71検体:¥14,000/検体
72検体以上:¥13,000/検体
1 PacBio Revio/Sequel IIeで読む
2 16S全長(約1,500 bp)が対象
1検体から DNAから 全長(V1–V9) 30,000 リード/検体 PacBio Revio/Sequel IIe 別料金 料金に含む 記載なし 30営業日
生物技研 登録企業
情報確認日: 2026-09-27
— ¥120,000 税抜 1〜7検体:¥20,000/検体
8〜39検体:¥15,000/検体
40〜47検体:¥13,500/検体
48〜55検体:¥12,000/検体
56〜63検体:¥11,000/検体
64〜71検体:¥10,500/検体
72検体以上:¥10,000/検体
1 糞便・土壌・水からDNA抽出から頼める
2 系統解析まで含む
1検体から 試料から(糞便・土壌などからのDNA抽出を含む) 記載なし 30,000 リード/検体 Illumina NextSeq 1000・MiSeq i100 Plus・MiSeq(2×300 bp) 料金に含む 料金に含む オプション(別料金) 20営業日(初回のPCRで良好な増幅が確認された場合)
ゲノムリード
情報確認日: 2026-09-27
— ¥42,000 税抜 ¥7,000/検体
1 複数の依頼を1ランにまとめる
2 約5万リード
3 V3–V4・V1–V3・V1–V2・V4から選べる
記載なし DNAから V3–V4・V1–V3・V1–V2・V4 50,000 リード/検体 MiSeq/NextSeq1000/MiSeq i100 別料金 オプション(別料金) オプション(別料金) 1〜2か月(あいのり解析の場合)
生物技研 登録企業
情報確認日: 2026-09-27
— ¥90,000 税抜 1〜7検体:¥15,000/検体
8〜39検体:¥12,000/検体
40〜47検体:¥10,500/検体
48〜55検体:¥9,000/検体
56〜63検体:¥8,000/検体
64〜71検体:¥7,500/検体
72検体以上:¥7,000/検体
1 抽出したDNAを送り系統解析まで
1検体から DNAから 記載なし 30,000 リード/検体 Illumina NextSeq 1000・MiSeq i100 Plus・MiSeq(2×300 bp) 記載なし 料金に含む オプション(別料金) 15営業日(初回のPCRで良好な増幅が確認された場合)
プリメディカ
情報確認日: 2026-09-27
— 対象外(最低20検体から) 20検体以上:¥50,000/検体
1 20検体から10営業日
20検体から 試料から(糞便・土壌などからのDNA抽出を含む) V3–V4 記載なし MiSeq(Illumina) 記載なし 料金に含む 料金に含む 10営業日(検体受領から)

ランキングの決め方:受注数・見積依頼数・価格(参考合計)・見積返信の速さ・ユーザー評価から計算しています。 受注数・見積依頼数・返信の速さ・評価は、受託解析Quick 上での直近12か月の実績です(実績がまだない項目は0点)。 広告(PR)の出稿や手数料の額では変わりません。 くわしく