SERVICE DETAILS
ノボジーン: 16S/18S/ITS アンプリコンメタゲノムシーケンス
ノボジーンが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方:
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
NovaSeq 6000で16S(V4・V3–V4など)・18S・ITS。50K〜500K raw tagsから選ぶ。料金は見積。
参考合計 (6検体)
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積(基本料金が非公開)
登録されている料金(すべて)
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 (必須) | 16S/18S/ITS アンプリコン | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | 16S/18S/ITS アンプリコンメタゲノムシーケンス (公式) | 公式ページに料金の記載なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
16S rRNA アンプリコンシーケンスによる菌叢解析(細菌叢解析)
細菌がもつ16S rRNA遺伝子の一部(または全長)を増やして読み、試料の中にどんな細菌が、どのくらいの割合でいるか(菌叢)を調べる解析です。腸内細菌・口腔・土壌・水などに使われます。
| 基本料金の起点 | DNAから 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 読む領域と方法 | |
| 増幅する領域 16S rRNA遺伝子のどの部分を読むか。全長はロングリードで種レベルまで推定しやすい | V4・V3–V4・その他 |
| ほかに対応する領域 | 真核生物(18S rRNA)・真菌(ITS) |
| シーケンサー | Illumina NovaSeq 6000 |
| リード長 | 250 bp |
| ペアエンド/シングルエンド | ペアエンド |
| データ量 | |
| リード数 1検体あたりに読む本数(ペアエンドは1組を1本)。多いほど少ない菌まで見つけやすい | 50,000 リード/検体 |
| データ量の補足 | 50K/100K/500K raw tags から選択(最少の50Kを登録)。その他の領域は V4–V5 |
| 試料と検体 | |
| 受け付ける試料 | 記載なし |
| DNAでの受付 | 受け付ける |
| DNA抽出 | 記載なし |
| 必要DNA量 | 200 ng |
| 必要な濃度 | 10 ng/µL |
| 必要な液量 | 20 µL |
| 検体の補足 | total DNA、OD260/280 = 1.8-2.0、分解・色・コンタミがないこと |
| 解析と納品 | |
| 菌の分類(属・種の推定) 読んだ配列を、どの菌のものか分類する | 料金に含む |
| 多様性解析(α・β) α多様性=1つの試料の中の菌の種類の豊かさ、β多様性=試料どうしの菌叢の違い | 料金に含む |
| 解析ソフト・データベース | QIIME(OTU/ASV) |
| 納品物 | 記載なし |
| 解析の補足 | 標準解析:データQC、OTU/ASV、分類学的アノテーション、α/β多様性(UPGMA、PCA、PCoA、NMDS)、Anosim/MRPP/Simper、T検定/MetaStat/LEfSe、機能予測 |
| 納期と解析場所 | |
| 納期 | 記載なし |
| 解析を行う場所 | 記載なし |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-09-27