SERVICE DETAILS
北海道システム・サイエンス： 微生物群集解析（乗り合い解析）
北海道システム・サイエンスが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方：
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
V3–V4（古細菌向け・真菌ITS1も可）。3〜5万リードペア。QIIME 2の標準解析つき。基本料金は要問い合わせ。
参考合計 （6検体）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積（基本料金が非公開）
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
16S rRNA アンプリコンシーケンスによる菌叢解析（細菌叢解析）
細菌がもつ16S rRNA遺伝子の一部（または全長）を増やして読み、試料の中にどんな細菌が、どのくらいの割合でいるか（菌叢）を調べる解析です。腸内細菌・口腔・土壌・水などに使われます。
| 基本料金の起点 | DNAから 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 読む領域と方法 | |
| 増幅する領域 16S rRNA遺伝子のどの部分を読むか。全長はロングリードで種レベルまで推定しやすい | V3–V4 |
| ほかに対応する領域 | 古細菌・真菌（ITS） |
| シーケンサー | NextSeq・MiSeq |
| リード長 | 300 bp |
| ペアエンド／シングルエンド | ペアエンド |
| データ量 | |
| リード数 1検体あたりに読む本数（ペアエンドは1組を1本）。多いほど少ない菌まで見つけやすい | 30,000 リード／検体 |
| データ量の補足 | 3～5万リードペア/1検体（乗り合い） |
| 試料と検体 | |
| 受け付ける試料 | 糞便・口腔（唾液・歯垢）・土壌・その他 |
| DNAでの受付 | 受け付ける |
| DNA抽出 | 別料金 |
| 必要DNA量 | 150 ng |
| 必要な濃度 | 5 ng/µL |
| 必要な液量 | 30 µL |
| 検体の補足 | 汚泥 5〜10 mL・土壌 1〜5 g（冷蔵）、糞便 0.2〜0.5 g・唾液 0.2〜1 mL（冷凍）。1st PCR産物・2nd PCR産物でも受け付け。パンフレット（2026年4月）では精製DNAの条件が「200 ng以上（10 ng/μL）」と書かれている |
| 解析と納品 | |
| 菌の分類（属・種の推定） 読んだ配列を、どの菌のものか分類する | 料金に含む |
| 多様性解析（α・β） α多様性＝1つの試料の中の菌の種類の豊かさ、β多様性＝試料どうしの菌叢の違い | 料金に含む |
| 解析ソフト・データベース | QIIME 2 |
| 納品物 | 記載なし |
| 解析の補足 | 標準：菌叢構成、α多様性、PCoAプロット、有意差検定（PERMANOVA）。オプション：Differential Abundance Analysis など |
| 納期と解析場所 | |
| 納期 | 記載なし |
| 解析を行う場所 | 記載なし |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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微生物群集解析 （公式）確認日 2026-09-27
