真菌ITS解析 受託サービス比較
カビや酵母などの真菌がもつITS領域を増やして読み、試料の中にどんな真菌が、どのくらいの割合でいるか（真菌叢・マイコバイオーム）を調べる解析です。
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真菌ITS解析（ITS領域のアンプリコンシーケンスによる真菌叢解析）
細菌の16S rRNAにあたるものが、真菌ではこのITSになります。価格より先に見たいのは、どこまで読むかです。ITSは ITS1 – 5.8S – ITS2 という並びで、ふつうは前半のITS1だけを短いリードで読みます。これが標準でいちばん安い方法です。全長を通して読めば種まで絞れることが増えますが、PacBioなどの長鎖シーケンサーが必要で、1検体あたりの値段は上がります。つぎにDNA抽出が料金に含まれるかどうかです。真菌は細胞壁が硬いので、菌類向けの抽出でないと収量が落ちます。「DNAを送ってください」のサービスは、ここを自分で済ませておく必要があります。3つめはリード数で、真菌叢は細菌叢より種数が少ないぶん3万リードでおおよそ足りますが、土壌のように種数が多い試料では足りないことがあります。
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各社の公開情報から計算した参考価格です。正式な金額は各社の見積で確認してください。
税区分は各社の表記によります。
「起点」は基本料金に含まれる最初の工程です
（起点が違うと、同じ金額でも含まれる作業が違います）。
料金を公開していない会社も「要見積」として並べています。
表の見出しの文字を押すと、その列で並べ替えられます
（もう一度押すと逆の順）。
記載なしは、いつも最後に並びます。
登録企業は、受託解析Quick 上で見積に直接回答します（未登録の会社にも依頼できます）。
表は左右にスクロールして詳細を比較できます。
| 見積 | 会社・サービス | ランキング ▼ | 参考合計（8検体） | 基本料金（単価） | 製品の特徴 | 最低検体数 | 起点 | 読む領域 | シーケンサー | リード数 | DNA抽出 | 多様性解析（α・β） | 納期 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
FASMAC
|
1
|
¥70,000 税区分：一部記載なし |
1〜8検体：¥70,000/一式 9〜16検体：¥125,000/一式 |
1
混合済みライブラリを送付
2
DNA抽出・PCRからはオプション
|
1検体から | 調製済みライブラリから（シーケンスのみ） | ITS（内訳の記載なし） | Illumina MiSeq i100 Plus | 記載なし | 別料金 | オプション（別料金） | 10〜15営業日（QC・シーケンス・QIIME 2標準解析のみの場合） | |
|
bitBiome
|
2 | ¥120,000 税抜 |
1〜7検体：¥20,000/検体 8検体以上：¥15,000/検体 |
1
ITSを短鎖で読む
2
QIIME 2で組成とα・β多様性まで
3
3〜6万リード
|
1検体から | 記載なし | ITS（内訳の記載なし） | 記載なし | 30,000 リード／検体 | 対応あり（条件は相談） | 料金に含む | 6〜8週（標準納期） | |
|
bitBiome
|
3 | ¥192,000 税抜 |
1〜7検体：¥35,000/検体 8検体以上：¥24,000/検体 |
1
PacBio RevioでITSを通して読む
2
DNA抽出と基本データ解析を含む
|
1検体から | 試料から（真菌のDNA抽出を含む） | ITS全長（ITS1–5.8S–ITS2） | PacBio Revio | 30,000 リード／検体 | 料金に含む | 料金に含む | 8週（標準納期） | |
|
北海道システム・サイエンス
|
— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
ITS1-F_KYO1／ITS2_KYO2 を使う
2
3〜5万リードペアでPERMANOVAまで標準
|
記載なし | DNAから | ITS1 | NextSeq・MiSeq | 30,000 リード／検体 | 別料金 | 料金に含む | 記載なし | |
|
マクロジェン・ジャパン
|
— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
MiSeq i100で2×300 bp
2
1st PCRからかライブラリからかを選べる
|
記載なし | DNAから | ITS（内訳の記載なし） | MiSeq i100 | 記載なし | 記載なし | 記載なし | 1〜1.5か月（サンプル到着からRaw data納品まで（平均）） | |
|
ノボジーン
|
— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
NovaSeq 6000で読む
2
50K／100K／500K raw tagsから選ぶ
3
多様性から機能予測まで標準
|
記載なし | DNAから | ITS（内訳の記載なし） | Illumina NovaSeq 6000 | 50,000 リード／検体 | 記載なし | 料金に含む | 記載なし | |
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GENEWIZ（アゼンタ）
|
— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
2×250 bpで40〜50kリードが目安
2
α／β多様性とLEfSeまで標準
3
国内で試料処理・解析は海外ラボ
|
記載なし | DNAから | ITS（内訳の記載なし） | イルミナ（機種の記載なし） | 40,000 リード／検体 | 対応あり（条件は相談） | 料金に含む | 20〜25営業日（核酸サンプルQCパス後から。海外ラボの場合は国際輸送（約5営業日）が加わる） |
ランキングの決め方：受注数・見積依頼数・価格（参考合計）・見積返信の速さ・ユーザー評価から計算しています。 受注数・見積依頼数・返信の速さ・評価は、受託解析Quick 上での直近12か月の実績です（実績がまだない項目は0点）。 広告（PR）の出稿や手数料の額では変わりません。 くわしく
