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全エクソーム解析(WES) 1件
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ヒト・マウスに対応。生データ・ベーシック・スタンダード・オーダーメイドの4プラン。料金は問い合わせ。
全ゲノム解析(WGS) 1件
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PE150。ヒト 90 Gb、細菌・真菌 1 Gb の例。生データのみ〜ベーシック(SNV・Indel)〜スタンダード(SV・CNVなど)〜オーダーメイドのプラン。料金はお問い合わせ。4〜7週(解析込み6〜9週)。
コピー数解析(CNV) 2件
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すでに持っているデータからコピー数解析だけを頼める。検体間の差の評価まで含む。持ち込めるデータの種類や納期はページに書かれていない。
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WGSの標準プランのオプション解析としてコピー数を調べる。腫瘍の検体ではLOHも併せて解析する。コピー数多型の一覧表と、ゲノム上の変化を描いた図が納品される。
bulk RNA-seq 2件
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生データ/ベーシック解析/スタンダード解析(DEG等)の3プラン。価格は非公開。
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PolyA選択法では検出できないlncRNAなども解析対象になる。Poly-A選択法のプランより納期は長い。価格は非公開。
miRNA・small RNA-seq 1件
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生データから解析まで4つのプランがある。手持ちのデータの解析だけでも頼める。新規miRNAの探索は標準の解析に含まれないと明記されている。
シングルセルRNA-seq 1件
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条件検討の支援つき。OCMで最大4検体・合計20,000細胞。Cell Rangerのベーシックから、細胞種の推定・RNA velocityなどのスタンダードまで。料金は要問い合わせ。
空間トランスクリプトーム解析 1件
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Visium HDで、最小2 µm×2 µmのグリッドの解像度で全トランスクリプトームを測る。検出できる遺伝子はヒト約18,000、マウス約19,000、ラット約21,000。FFPEブロックまたはFFPE切片が基...
シングルセルATAC-seq(scATAC-seq) 2件
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凍結組織・凍結細胞を預かり、良いデータが出る裸核の条件を詰めるところから引き受ける。プランは3段で、解析だけの依頼もできる。
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同じ1つの核から、開いている場所と遺伝子発現の両方を取る。細胞種のあてはめ、擬似時間、RNA Velocityまでオプションで選べる。
ATAC-seq(オープンクロマチン解析) 2件
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実験は自分でやって、手元のFASTQから解析だけ頼む場合。データを受け取ってから2〜4週。過去に取ったデータでも受けてくれる。
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凍結組織や凍結細胞を預かり、核抽出から引き受ける。フットプリンティングやRNA-seqとの統合までプランで選べる。
DNAメチル化解析(WGBS・RRBS・ターゲット) 3件
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MspIでDNAを切ってCpGリッチな領域を濃縮してから読む。9 Gb/60 Mリードで済む。エピジェネティッククロック解析もオプションにある。
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実験は自分でやって、手元のFASTQから解析だけ頼む場合。データを受け取ってから3〜5週。過去に取ったデータでも受けてくれる。
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ゲノム全体のメチル化を見る。標準は90 Gb/600 Mリード。生データなら6〜8週、解析まで入れて8〜10週。
16S rRNA 菌叢解析 1件
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生データプラン(FASTQのみ)と、解析つきのベーシック/スタンダードプラン。料金は見積。
de novoゲノム解析 1件
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アセンブルだけでなく、精度の評価、遺伝子構造の予測、機能アノテーション、RNA-seqを使ったアノテーションまで含むプラン。生データだけのプランは6〜8週。
NGSデータ解析(DRY解析) 1件
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手元のFASTQを送れば解析だけ頼める。RNA-seqからWGS/WES、ATAC、ChIP、メチル化まで横断。納期2〜5週。料金は要見積。