SERVICE DETAILS
Rhelixa： RRBS（CpGの多い領域を濃縮・PE150・9 Gb）
Rhelixaが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方：
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
MspIでDNAを切ってCpGリッチな領域を濃縮してから読む。9 Gb／60 Mリードで済む。エピジェネティッククロック解析もオプションにある。
参考合計 （2検体）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積（基本料金が非公開）
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析する検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 （必須） | RRBS | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | RRBS（株式会社Rhelixa） （公式） | 公開価格なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
DNAメチル化解析（WGBS・RRBS・ターゲット・パネル）
DNAのどこがメチル化されているかを次世代シーケンサーで調べるサービスです。最初に決めるのはゲノムのどこまで見るかで、ここで費用が一桁変わります。WGBSはゲノム全体を見るのでCpGをほぼ取りこぼしませんが、1検体あたり90〜150 Gbほど必要です。RRBSは制限酵素でCpGの多い領域だけを濃縮してから読むので9 Gbほどで済みますが、見ているのはCpGアイランドまわりに偏ります。ターゲットはあらかじめ決めた領域だけをキャプチャするもので、ヒトやマウスの既製パネルがあります。2つめは変換のしかたです。バイサルファイト処理は古くからの標準ですが、DNAが傷みやすく投入量が要ります。酵素による変換は薬品で焼かないぶんDNAが壊れにくく、少ない量や質の落ちた試料で有利とされます。3つめはどこまで解析してくれるかで、メチル化率を出すところまでか、群間で差のあるCpGや領域を見つけて近くの遺伝子のGO解析まで見てくれるのかが分かれます。DMR解析は最低でも2検体ないとできません。
| 基本料金の起点 | 精製したDNAを送る 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 方式と変換 | |
| 解析の範囲 ここで費用が一桁変わる。全ゲノムで見るか、CpGの多いところだけにするか | RRBS（CpGの多い領域を濃縮） |
| 変換のしかた | バイサルファイト処理 |
| ターゲットの絞り方 ターゲットを選んだときだけ。領域の決め方で必要なDNA量と見える範囲が変わる | 記載なし |
| 5hmCの区別 ふつうのバイサルファイト法では5mCと5hmCを区別できない | 記載なし |
| ライブラリーのキット | 記載なし |
| シーケンサーとリード | 150×2のペアエンド（PE150） |
| 標準のデータ量 | 9 Gb／60 Mリード |
| 方式の補足 | MspI制限酵素を使ってDNAを切断し、メチル化しやすいCpGリッチ領域を濃縮してから読む。CpGアイランドまわりを選んで見るので、全ゲノムよりデータ量がずっと少なくて済む |
| 引き受ける工程と試料 | |
| 引き受ける工程 | DNA抽出・ライブラリー調製・シーケンス・データ解析 |
| 試料の条件 | 記載なし |
| 分子バーコード | 記載なし |
| 変換効率の確認 | 記載なし |
| パネルの中身 | 記載なし |
| 解析と納品 | |
| 含まれる解析 | メチル化率の算出・差のあるCpG・領域（DMC・DMR）・アノテーション（CpGアイランド・近傍遺伝子）・相関・主成分分析・クラスタリング・GO解析・エピジェネティッククロック |
| プランの立て方 | 生データプランは生データのみ。ベーシックはデータQC、トリミング、マッピング、メチル化率算出、ゲノムとCpGのアノテーション、相関分析、主成分分析、階層的クラスタリング。スタンダードはこれにDMC・DMRの検出、GO解析、エピジェネティッククロック解析をオプションで足せる。オーダーメイドはRNA-seqやChIP-seqとのマルチオミクス統合、公共データとの比較、論文用の図版まで |
| 解析だけの依頼 | 記載なし |
| 納品されるもの | FASTQ（生データ）・メチル化率・DMR の一覧・図表 |
| 納期ほか | |
| 納期 | 8〜10週（解析プランの場合。サンプル到着から） |
| 実験するラボ | 国内 |
| 日本語での相談 | 国内に窓口がある |
| 受注の条件・補足 | 納品物には、アノテーション付きのDMC・DMR一覧、近傍遺伝子の一覧、ヒートマップ、GO解析の結果、相関行列、主成分分析やクラスタリングの図が含まれる |
| 料金の補足 | 公開価格なし |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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RRBS（株式会社Rhelixa） （公式）確認日 2026-10-04
実施機関の自社ページ
