SERVICE DETAILS
Rhelixa: ATAC-seqのデータ解析のみ(FASTQ持込・2〜4週)
Rhelixaが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方:
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
実験は自分でやって、手元のFASTQから解析だけ頼む場合。データを受け取ってから2〜4週。過去に取ったデータでも受けてくれる。
参考合計 (2検体)
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積(基本料金が非公開)
登録されている料金(すべて)
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析する検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 (必須) | ATAC-seqのデータ解析 | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | バイオインフォマティクス解析(株式会社Rhelixa) (公式) | 公開価格なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
ATAC-seq(バルクのクロマチンアクセシビリティ解析)
Tn5トランスポゼースが開いているところにだけ入り込む性質を使って、ゲノムのどこが開いているかをまとめて読むサービスです。抗体を使わないのでChIP系より手軽ですが、うまくいくかどうかはほぼきれいな核が取れるかで決まります。そこで最初に見るのは、何を送れるかと核抽出を引き受けてくれるかです。凍結細胞や凍結組織から核抽出まで任せられるか、死細胞が多い試料で生きた細胞を選り分けてくれるか。ここを自分でやるとなると、慣れていない研究室にはいちばんの難所になります。2つめは必要な細胞数で、5万個でよいのか10万個を3本なのかで、手持ちの試料で足りるかが変わります。3つめはどこまで解析してくれるかです。ピークを出すのは当たり前で、そのあと群間で差のあるピーク、転写因子の結合モチーフ、フットプリンティング、RNA-seqとの統合のどこまで見てくれるかで差が出ます。4つめは実験を自分でやってデータ解析だけ頼めるかで、手元にFASTQがあるならそこだけ外に出すのがいちばん安く済みます。
| 基本料金の起点 | FASTQを送る(解析だけ頼む) 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 送るものと核の調製 | |
| 受け付ける試料 | FASTQ(解析のみ) |
| 核抽出 | 記載なし |
| 死細胞の除去 | 記載なし |
| 必要な細胞数 | 記載なし |
| 試料の条件 | 記載なし |
| シーケンスと解析 | |
| シーケンスの仕様 | 記載なし |
| 含まれる解析 ピークを出すのは当たり前。その先がどこまでかで差が出る | ピークコール・群間で差のあるピーク・結合モチーフ解析・フットプリンティング・近傍遺伝子・アノテーション・クラスタリング・主成分分析・GO解析 |
| ATAC特有のQC | 記載なし |
| プランの立て方 | ベーシック解析とスタンダード解析のプランが用意されている。内容はATAC-seqのサービスページと同じ区分 |
| 解析だけの依頼 | FASTQからの解析だけでも頼める |
| 方式の補足 | 記載なし |
| 納品と納期 | |
| 納品されるもの | ピーク・変動ピークの一覧・図表(ヒートマップなど) |
| 納期 | 2〜4週(データを受け取った日から起算した参考納期) |
| 実験するラボ | 国内 |
| 日本語での相談 | 国内に窓口がある |
| 受注の条件・補足 | 手元にあるFASTQファイルを送る。過去に取得したデータを使った解析にも対応している |
| 料金の補足 | 公開価格なし |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-10-04
実施機関の自社ページ。解析のみの納期一覧がある