DNAチップ研究所 のサービス

特定領域のPCR産物を送り、アダプター付加からシーケンス・全長配列の集計まで。推奨200〜300 bp。料金は要問い合わせ。

11種類のパネルから選ぶか、カスタムを作る。分子バーコードを使って約1%の体細胞変異まで見る。FFPEとcfDNAにも対応。

SureSelect V6／V7／V8。FreeBayesとGATKのダブルパイプライン解析。料金は問い合わせ。

Infiniumアレイでゲノム全体のSNPを判定。ヒト（GSA・ASA・Omniなど）と動物のアレイ。連鎖解析・GWASはオプション。料金は要問い合わせ。

Bio-RadのQX200で、ゲノムDNAのコピー数を絶対定量する。検体のQC結果、Droplet Readerから書き出した生データ、コピー数の測定結果表まで納品される。

企画提案型。PolyA精製・rRNA除去・グロビン除去から選択。フナコシ経由でも販売。価格表は画像のみ。

Bio-Rad QX200で、検量線の作製や繰り返し実験をせずに高い精度で絶対定量する。希少変異解析とコピー数多型（CNV）の測定が主な用途。納期はサンプルのQC通過後 約2か月とやや長め。QC結果、QX200の生...

この分類で唯一UMI（分子バーコード）に対応する。血清・血漿由来は10 ngから、エクソソーム画分は1 mL程度でも受けるので、リキッドバイオプシーの検体を持っている人に向く。

免疫沈降は依頼者側で行い、ChIP後のdsDNAを送る。100 ng以上・200〜800 bp。ピーク検出とサンプル間比較まで。QC通過後2か月、解析込みで2.5か月。

がん種別の既製パネルを選ぶか、カスタムを作る。組織・細胞のDNAなら2 ng、FFPEやccfDNAでも20 ngから。分子バーコードでメチル化率を正確に出す。

既製パネルではなく、自分で決めた領域を指定のプライマーで増やして読む。プライマーの合成も頼める。BAMファイルまで納品される。