Rhelixa： シングルセルATAC-seq（裸核の条件検討から・国内）

1細胞ずつ、ゲノムのどこが開いているかを調べるサービスです。まず決めるのはATAC単独でいくかマルチオームにするかです。マルチオームは同じ1つの核から開いている場所と遺伝子発現の両方を取るので、その細胞集団が何なのかを発現で決められ、細胞種のあてはめがはるかに楽になります。そのぶん費用は上がります。2つめは何を送るかで、ここがこの分類でいちばん事故が起きるところです。scATAC-seqはきれいな裸核が取れるかでほぼ決まるので、凍結組織から核を取る条件を受託側で詰めてくれるかどうかが大きな差になります。3つめはどこまで解析してくれるかです。カウントマトリックスを作るところまではどこも同じで、そのあとクラスタリング、細胞種のあてはめ、擬似時間、ほかのデータとの統合まで面倒を見てくれるかで分かれます。4つめはどこのラボで実施するかで、同じ会社でもATAC単独は海外、マルチオームは国内という分かれ方をすることがあります。