タンパク質間相互作用解析 受託サービス比較
タンパク質どうしのくっつき方を調べる受託です。
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タンパク質間相互作用解析（SPR・Co-IP・AP-MS・酵母ツーハイブリッド・近接標識）
一言で呼ばれていますが、中身は3つに分かれます。既知ペアの確認・定量は、相手が分かっていてどれくらい強くくっつくかを数値で出すこと。未知の相手の探索は、ベイトになるタンパク質を決めて何がくっついてくるかを探すこと。界面・ドメインのマッピングは、どこでくっついているかを絞り込むことです。2つめは測り方で、同じ「くっつく」でも見ているものが違います。SPRとBLIは精製した分子どうしを試験管の中で見るので直接の結合だけが分かり、Co-IPとAP-MSは細胞をすりつぶした液の中で複合体ごと引っぱるので間接的につながっているものも入ります。酵母ツーハイブリッドは酵母の中で2分子が近づくかを見て、近接標識（BioID・TurboID・APEX）は生きた細胞の中で近くにあるタンパク質に目印を付けるので、弱い相互作用や一瞬だけの相互作用を捉えやすくなります。3つめはどこで測るかで、試験管の中、細胞抽出液の中、酵母の中、生きた細胞の中では、生理的なもっともらしさも拾えるものも違います。4つめは偽陽性への備えで、探索型の方法ではたまたま一緒に引っぱられてきただけのタンパク質が混ざるため、対照の置き方・フィルタリング・信頼度スコアがあるかどうかで結果の読み方が変わります。
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各社の公開情報から計算した参考価格です。正式な金額は各社の見積で確認してください。
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「起点」は基本料金に含まれる最初の工程です
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| 見積 | 会社・サービス | ランキング ▲ | 参考合計（1検体） | 基本料金（単価） | 製品の特徴 | 最低検体数 | 起点 | 解析方式 | どこで測るか | 出てくるもの | 必要な試料 | 納期 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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フィルジェン
※Creative Proteomics 実施
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
抗体・バッファー・ビーズの条件を詰める
2
SDS-PAGEとウェスタンブロットで確かめる
3
必要な試料が種類ごとに公開されている
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記載なし | 細胞・組織を送る | 共免疫沈降（Co-IP） | 細胞抽出液の中 | くっついてきた相手の一覧・条件間の定量比較 | 細胞ライセート（ベイトを発現させた細胞）200 µL〜1 mL。 組織ホモジネート（新鮮に調製したもの）50 mg／500 µLバッファー。 精製タンパク質（タグ付きが理想）50〜200 µg。 血清・血漿（ヒトまたは動物由来）100 µL〜1 mL。 形質転換細胞（プラスミド導入）1×10の6乗〜5×10の6乗個 | 記載なし | |
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フィルジェン
※Creative Proteomics 実施
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
生きた細胞の中でビオチンの目印を付ける
2
弱い相互作用や一瞬の相互作用も捉える
3
細胞内の区画ごとの顔ぶれも分かる
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記載なし | 細胞・組織を送る | 近接標識（BioID・TurboID・APEX） | 生きた細胞の中 | くっついてきた相手の一覧・条件間の定量比較 | ラベルフリーの解析は5×10の6乗細胞、DIA型のワークフローは1×10の7乗細胞から | 記載なし | |
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フィルジェン
※Creative Proteomics 実施
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
アフィニティ精製してLC-MS/MSで同定
2
FLAG・HA・His・Mycなどのタグに対応
3
信頼度スコアで偽陽性を減らす
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記載なし | 細胞・組織を送る | AP-MS（アフィニティ精製＋質量分析） | 細胞抽出液の中 | くっついてきた相手の一覧・相互作用ネットワーク・条件間の定量比較 | 培養細胞（接着・浮遊）は1レプリケートあたり通常10の7乗〜10の8乗個（タンパク質の量による）。 組織（新鮮または急速凍結）は1レプリケートあたり50〜200 mg。 組換えタンパク質複合体と初代細胞は、相談のうえ決める | 記載なし | |
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福島セルファクトリー
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
Biacore T200でka・kd・KDを出す
2
相手が分かっている2分子について測る
3
納期は通常1か月程度
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記載なし | 精製タンパク質・プラスミドを送る | SPR・BLI（表面プラズモン共鳴ほか） | 試験管の中（精製した分子どうし） | KD・ka・kd（結合の強さと速さ） | リガンドは50 µg/mL以上の濃度で150 µL以上。アナライトは10 µM以上の濃度が目安で、低分子化合物の場合は1 mM以上必要なことがある | 1か月（通常1か月程度。試験の内容やサンプル数によって変わる） |
ランキングの決め方：受注数・見積依頼数・価格（参考合計）・見積返信の速さ・ユーザー評価から計算しています。 受注数・見積依頼数・返信の速さ・評価は、受託解析Quick 上での直近12か月の実績です（実績がまだない項目は0点）。 広告（PR）の出稿や手数料の額では変わりません。 くわしく
