コピー数解析（CNV） 受託サービス比較
遺伝子やゲノム領域のコピー数が増えているか減っているかを調べるサービスです。
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コピー数解析（CNV・LOH／アレイ・デジタルPCR・NGS）
まず解析のしかたで見えるものが変わります。デジタルPCRは指定した1〜数か所をコピー数そのものとして数えるので、いちばん正確ですが、知らない場所の変化は見つけられません。SNPアレイやMIPアレイ、全ゲノムシーケンスはゲノム全体を見るので未知のコピー数異常を探せますが、数字は相対的な推定になります。アレイやNGSで見つけた候補をデジタルPCRで確かめる、という順番で使うことが多いです。2つめは見える範囲で、指定した1か所を確かめたいのか、選んだ遺伝子群なのか、ゲノム全体なのかで相手が変わります。3つめは数え方で、絶対定量か相対推定かによって結果の読み方が変わります。4つめは送るもので、FFPEを受けてくれるか、組織や血液からDNA抽出まで頼めるかが分かれ目です。FFPEは断片化しているため、専用に設計されたアレイを使う会社に限られます。
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各社の公開情報から計算した参考価格です。正式な金額は各社の見積で確認してください。
税区分は各社の表記によります。
「起点」は基本料金に含まれる最初の工程です
（起点が違うと、同じ金額でも含まれる作業が違います）。
料金を公開していない会社も「要見積」として並べています。
表の見出しの文字を押すと、その列で並べ替えられます
（もう一度押すと逆の順）。
記載なしは、いつも最後に並びます。
登録企業は、受託解析Quick 上で見積に直接回答します（未登録の会社にも依頼できます）。
表は左右にスクロールして詳細を比較できます。
| 見積 | 会社・サービス | ランキング ▼ | 参考合計（20検体） | 基本料金（単価） | 製品の特徴 | 最低検体数 | 起点 | 解析のしかた | 見える範囲 | 調べられること | 数え方 | 受け付ける試料 | 納期 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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フィルジェン
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1
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¥1,980,000 税抜 | 20〜24検体：¥99,000/検体 |
1
マーカー数を約75万に絞った廉価版
2
CytoScan HDと同じ流れ
|
10検体から | 組織・細胞・血液を送る | SNPアレイ | ゲノム全体 | コピー数の増減 | 相対推定（比べて推定する） | 精製したDNA・組織・細胞・血液 | 記載なし | |
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フィルジェン
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2 | ¥2,840,000 税抜 | 20〜24検体：¥142,000/検体 |
1
約270万マーカーでゲノム全体を見る
2
ヒトのCNV解析用に作られたアレイ
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10検体から | 組織・細胞・血液を送る | SNPアレイ | ゲノム全体 | コピー数の増減 | 相対推定（比べて推定する） | 精製したDNA・組織・細胞・血液 | 記載なし | |
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ユーロフィンジェネティックラボ
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
全血から未染スライドまで受け付ける
2
DNA抽出もオプションで頼める
3
制限酵素処理でタンデムコピーか判定できる
|
記載なし | 組織・細胞・血液を送る | デジタルPCR（ddPCR） | 指定した1〜数か所 | コピー数の増減・タンデムコピーかどうか | 絶対定量（コピー数そのものを数える） | 精製したDNA・血液・血清・血漿など・組織・細胞・FFPE・未染スライド | 記載なし | |
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DNAチップ研究所
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
Bio-RadのQX200で絶対定量
2
Droplet Readerの生データも納品される
3
検体のQC結果も付く
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記載なし | 精製したDNAを送る | デジタルPCR（ddPCR） | 指定した1〜数か所 | コピー数の増減 | 絶対定量（コピー数そのものを数える） | 精製したDNA | 2か月（検体のQCを通ってから2か月程度。試薬の納期で変わることがある） | |
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フィルジェン
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
FFPEの劣化したDNAでも見られる
2
解像度は約50〜100 kb
3
Plusは9遺伝子74変異の体細胞変異も見る
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10検体から | 組織・細胞・血液を送る | MIPアレイ（FFPE向け） | ゲノム全体 | コピー数の増減・LOH（ヘテロ接合性の消失）・体細胞変異も同時に | 相対推定（比べて推定する） | FFPE | 記載なし | |
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フィルジェン
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
リアルタイムPCRで指定領域のコピー数を見る
2
組織・細胞・血液・体液から受け付ける
3
必要なDNA量の計算式が公開されている
|
記載なし | 組織・細胞・血液を送る | リアルタイムPCR | 指定した1〜数か所 | コピー数の増減 | 相対推定（比べて推定する） | 精製したDNA・組織・細胞・血液・血清・血漿など | 3週（TaqMan Probeの入荷とサンプル到着のあと3週間程度。検体数やオプション作業で変わることがある） | |
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Rhelixa
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
WGSの標準プランのオプション解析
2
腫瘍の検体ではLOHも併せて解析
3
一覧表とゲノム上の変化の図が納品される
|
記載なし | 精製したDNAを送る | 全ゲノムシーケンス（WGS） | ゲノム全体 | コピー数の増減・LOH（ヘテロ接合性の消失） | 相対推定（比べて推定する） | 記載なし | 6〜9週（複数の解析を組み合わせた場合の参考納期として6〜9週と書かれている） | |
|
Rhelixa
|
— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
すでに持っているデータから頼める
2
検体間の差の評価まで含む
3
持ち込めるデータの種類は書かれていない
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記載なし | 手持ちのデータを送る（解析だけ） | 記載なし | 記載なし | コピー数の増減 | 記載なし | 記載なし | 記載なし | |
|
GENEWIZ（アゼンタ）
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
点変異・挿入欠損と一緒にコピー数も調べる
2
FFPE薄片や綿棒からでも受け付ける
3
選んだ遺伝子だけを深く読む
|
記載なし | 組織・細胞・血液を送る | ターゲットNGS | 選んだ遺伝子・領域 | コピー数の増減・体細胞変異も同時に | 相対推定（比べて推定する） | 精製したDNA・細胞・組織・血液・FFPE・綿棒 | 記載なし | |
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マクロジェン・ジャパン
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
WGSの解析メニューのひとつ
2
条件はページに書かれていない
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記載なし | 精製したDNAを送る | 全ゲノムシーケンス（WGS） | ゲノム全体 | コピー数の増減 | 記載なし | 記載なし | 記載なし | |
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京都大学iPS細胞研究財団
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
Infinium OmniExpress-24を使う
2
PennCNVなどでCNV解析ができる
3
依頼できるのはiPS細胞の研究機関に限られる
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記載なし | 精製したDNAを送る | SNPアレイ | ゲノム全体 | コピー数の増減 | 相対推定（比べて推定する） | 精製したDNA | 記載なし |
ランキングの決め方：受注数・見積依頼数・価格（参考合計）・見積返信の速さ・ユーザー評価から計算しています。 受注数・見積依頼数・返信の速さ・評価は、受託解析Quick 上での直近12か月の実績です（実績がまだない項目は0点）。 広告（PR）の出稿や手数料の額では変わりません。 くわしく
