BCR解析 受託サービス比較
B細胞受容体(BCR)=抗体の遺伝子配列を読んで、どのクローンがどれだけいるかを調べる解析です。
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BCR解析(B細胞受容体レパトア解析)
TCR解析と対になりますが、BCRには見どころが3つ増えます。1つめはアイソタイプで、IgM・IgG・IgA・IgD・IgEのどれなのか、IgMからIgGへ乗り換えるクラススイッチを追えるかどうかが効きます。2つめは体細胞超変異(SHM)で、B細胞は免疫応答のなかで可変領域に変異を入れて抗原への結合を強めていくため、その履歴を見るにはCDR3だけでなく可変領域の全長が要ります。3つめは重鎖と軽鎖(VH/VL)のペアで、組が取れればその抗体をそのまま作り直せます。いちばん大事な分かれ目はTCRと同じくバルクかシングルセルかで、バルクは安くクローンの増減を追えますが重鎖と軽鎖の組は分かりません。入力がRNAかゲノムDNAかも効きます。ゲノムDNAは1細胞1コピーなのでクローン数を数えやすい反面、アイソタイプは転写産物に出る情報なので見えにくくなります。
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| 見積 | 会社・サービス | ランキング ▲ | 参考合計(4検体) | 基本料金(単価) | 製品の特徴 | 最低検体数 | 起点 | 解析タイプ | 対応する鎖 | 見分けられるアイソタイプ | VH/VLペアの取得 | 入力材料 | 納期 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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GENEWIZ(アゼンタ)
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
重鎖と軽鎖を物理的にペアリング
2
同じ細胞の遺伝子発現もあわせて取れる
3
必要な細胞数や納期の記載はない
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記載なし | 細胞・組織・血液を送る | シングルセル V(D)J | 記載なし | 記載なし | 同一B細胞の重鎖・軽鎖のペアが取れる | RNA・cDNA | 記載なし | |
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GENEWIZ(アゼンタ)
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
増幅法を5'RACEと明記している
2
血液や組織など抽出前の材料からでも出せる
3
バルクなので重鎖と軽鎖の組は取れない
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記載なし | 細胞・組織・血液を送る | バルクレパトア | 記載なし | 記載なし | 取れない(バルクのため) | RNA・cDNA | 記載なし | |
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タカラバイオ
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
アイソタイプを7種類から読み分けられる
2
セルソーターでの細胞分取も頼める
3
必要なRNA量が検体ごとに公開されている
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記載なし | 細胞・組織・血液を送る | バルクレパトア | 重鎖(IGH)・軽鎖κ(IGK)・軽鎖λ(IGL) | IgM・IgG・IgA・IgD・IgE | 取れない(バルクのため) | RNA・cDNA | 記載なし |
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