SERVICE DETAILS
Rhelixa： ATAC-seq（凍結組織・凍結細胞から核抽出・国内）
Rhelixaが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方：
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
凍結組織や凍結細胞を預かり、核抽出から引き受ける。フットプリンティングやRNA-seqとの統合までプランで選べる。
参考合計 （2検体）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積（基本料金が非公開）
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析する検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 （必須） | ATAC-seq | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | ATAC-seq（株式会社Rhelixa） （公式） | 公開価格なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
ATAC-seq（バルクのクロマチンアクセシビリティ解析）
Tn5トランスポゼースが開いているところにだけ入り込む性質を使って、ゲノムのどこが開いているかをまとめて読むサービスです。抗体を使わないのでChIP系より手軽ですが、うまくいくかどうかはほぼきれいな核が取れるかで決まります。そこで最初に見るのは、何を送れるかと核抽出を引き受けてくれるかです。凍結細胞や凍結組織から核抽出まで任せられるか、死細胞が多い試料で生きた細胞を選り分けてくれるか。ここを自分でやるとなると、慣れていない研究室にはいちばんの難所になります。2つめは必要な細胞数で、5万個でよいのか10万個を3本なのかで、手持ちの試料で足りるかが変わります。3つめはどこまで解析してくれるかです。ピークを出すのは当たり前で、そのあと群間で差のあるピーク、転写因子の結合モチーフ、フットプリンティング、RNA-seqとの統合のどこまで見てくれるかで差が出ます。4つめは実験を自分でやってデータ解析だけ頼めるかで、手元にFASTQがあるならそこだけ外に出すのがいちばん安く済みます。
| 基本料金の起点 | 細胞・組織を送る（核抽出から） 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 送るものと核の調製 | |
| 受け付ける試料 | 凍結した細胞・凍結した組織 |
| 核抽出 | 受託側で行う |
| 死細胞の除去 | 記載なし |
| 必要な細胞数 | 記載なし |
| 試料の条件 | 凍結組織または凍結細胞から核を抽出して進める |
| シーケンスと解析 | |
| シーケンスの仕様 | 150×2のペアエンド（PE150）。9 Gb／60 Mリードが参考例で、データ量もリード長も変更できる |
| 含まれる解析 ピークを出すのは当たり前。その先がどこまでかで差が出る | ピークコール・群間で差のあるピーク・結合モチーフ解析・フットプリンティング・近傍遺伝子・アノテーション・クラスタリング・主成分分析・GO解析・RNA-seqとの統合 |
| ATAC特有のQC | 通常のQCに加えて、ATAC-seq特有のフラグメントサイズ分布を計算する |
| プランの立て方 | 生データプランは生データのみ。ベーシックはQC、トリミング、マッピング、ピークコール、リードカウントの正規化、近傍遺伝子のアノテーション、クラスタリング、主成分分析、相関評価、ヒートマップ、シグナルヒートマップ。スタンダードはベーシック全部に加えて、変動ピークの検出、結合モチーフ解析、GO解析、転写因子のフットプリンティング、3群以上の比較をオプションで選べる。オーダーメイドはカスタム解析、参考文献の再現、マルチオミクス、公共データとの統合 |
| 解析だけの依頼 | FASTQからの解析だけでも頼める |
| 方式の補足 | 記載なし |
| 納品と納期 | |
| 納品されるもの | FASTQ（生データ）・ピーク・変動ピークの一覧・図表（ヒートマップなど） |
| 納期 | 記載なし |
| 実験するラボ | 国内 |
| 日本語での相談 | 国内に窓口がある |
| 受注の条件・補足 | バイオインフォマティクス解析のみの依頼も受けている（別サービスとして登録） |
| 料金の補足 | 公開価格なし。納期は預かった日から起算した参考週数で案内される |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-10-04
実施機関の自社ページ
