SERVICE DETAILS
GENEWIZ(アゼンタ): エピATAC(シングルセルATAC-Seq・米国ラボ)
GENEWIZ(アゼンタ)が提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方:
直接取引のみ
代理店を介さず、お見積り・納品・ご請求を研究室と直接行います。
所属機関の購買ルールで代理店を通す必要がある場合は、ご注意ください。
このサービスについて
磁気ビーズで死細胞を除いてから10x Chromiumに載せる。生細胞1万個程度の細胞ペレットや凍結組織から受ける。日本窓口はあるが、実験は米国ラボ。
参考合計 (2検体)
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積(基本料金が非公開)
登録されている料金(すべて)
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析する検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 (必須) | エピATAC | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | Single-Cell ATAC-Seq(GENEWIZ from Azenta) (公式) | 公開価格なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
シングルセルATAC-seq(1細胞・1核レベルのクロマチンアクセシビリティ解析)
1細胞ずつ、ゲノムのどこが開いているかを調べるサービスです。まず決めるのはATAC単独でいくかマルチオームにするかです。マルチオームは同じ1つの核から開いている場所と遺伝子発現の両方を取るので、その細胞集団が何なのかを発現で決められ、細胞種のあてはめがはるかに楽になります。そのぶん費用は上がります。2つめは何を送るかで、ここがこの分類でいちばん事故が起きるところです。scATAC-seqはきれいな裸核が取れるかでほぼ決まるので、凍結組織から核を取る条件を受託側で詰めてくれるかどうかが大きな差になります。3つめはどこまで解析してくれるかです。カウントマトリックスを作るところまではどこも同じで、そのあとクラスタリング、細胞種のあてはめ、擬似時間、ほかのデータとの統合まで面倒を見てくれるかで分かれます。4つめはどこのラボで実施するかで、同じ会社でもATAC単独は海外、マルチオームは国内という分かれ方をすることがあります。
| 基本料金の起点 | 細胞・組織を送る 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 測定のしかた | |
| 測定モード マルチオームは同じ核から発現も取れるので、細胞種のあてはめが楽になる | scATAC単独(開いている場所だけ) |
| プラットフォーム | 10x Genomics Chromium(シーケンスはIllumina NovaSeq) |
| 必要な細胞数・試料 | 生細胞1万個程度の細胞ペレットから受け付ける |
| 方式の補足 | 磁気ビーズを使って死細胞を除いてから、10x Genomics Chromiumで1細胞ずつに分け、ライブラリーを調製してIllumina NovaSeqでシーケンスする。細胞のほか、GEMや10xバーコード付きライブラリーなど、10xのワークフローの途中の状態でも受け付ける |
| 送るものと核の調製 | |
| 受け付ける試料 | 凍結組織・生細胞・細胞ペレット |
| 裸核の条件検討 | 記載なし |
| 試料の条件 | 記載なし |
| 解析と納品 | |
| 一次解析のパイプライン | Cell Ranger(標準プラン)。上位プランはSeuratによる解析 |
| 二次解析 | クラスタリング・UMAP・細胞種のあてはめ・擬似時間・軌跡 |
| 解析だけの依頼 | 記載なし |
| プランの立て方 | 記載なし |
| 納品されるもの | FASTQ(生データ)・カウントマトリックス |
| 実施場所と納期 | |
| 納期 | 記載なし |
| 実験するラボ | 海外 |
| 日本語での相談 | 国内に窓口がある |
| 受注の条件・補足 | 日本向け資料では「エピATAC」として掲載されており、この項目だけ米国ラボでの実施と注記されている。日本語での相談と手配はアゼンタ株式会社が窓口になる |
| 料金の補足 | 公開価格なし。納期はアプリケーション、提出物、難度によって変わるため問い合わせ |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-10-04
実施機関の自社ページ
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確認日 2026-10-04
日本向け資料。実施ラボと納品物の根拠