遺伝子パネル解析(ターゲットシーケンス) 受託サービス比較
決めた遺伝子だけを深く読んで、変異を探すサービスです。
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遺伝子パネル解析(ターゲットリシーケンス・がんパネル・カスタムパネル)
最初に見るのは濃縮のしかたで、見た目は同じパネルでも中身が違います。アンプリコン法はプライマーで狙った場所だけを増やすので、必要なDNAが少なく深く読めますが、増幅した断片しか見ないためコピー数の変化や融合遺伝子は原理的に苦手です。ハイブリッドキャプチャ法はプローブで釣り上げるので領域を広く取れて均一性が高く、コピー数や再構成まで見えるかわりにDNAが多めに要ります。2つめは何を検出できると書いてあるかで、点変異とInDelはどこでも見ますが、CNVと融合遺伝子は対応が分かれます。同じ会社の中でも、キャプチャ型では見えてアンプリコン型のホットスポットパネルでは見えない、ということが起きます。3つめは検体で、FFPEとcfDNAはDNAが短く壊れているため対応している会社が限られます。UMI(分子バーコード)があると、PCRの間違いと本物の低頻度変異を区別できます。4つめはどこから引き受けてもらうかで、自分で設計してライブラリーまで作る人ならシーケンスだけ頼む手もあります。
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各社の公開情報から計算した参考価格です。正式な金額は各社の見積で確認してください。
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| 見積 | 会社・サービス | ランキング ▼ | 参考合計(2検体) | 基本料金(単価) | 製品の特徴 | 最低検体数 | 起点 | パネルの種類 | 濃縮のしかた | 検出できる変異 | 遺伝子数・パネルの規模 | 受け付ける検体 | 納期 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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DNAチップ研究所
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
11種類のパネルから選ぶかカスタムを作る
2
分子バーコードで約1%の体細胞変異まで
3
FFPEとcfDNAにも対応
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記載なし | 精製したDNAを送る | 既製のがんパネル・遺伝性疾患のパネル・カスタム設計 | アンプリコン法 | 点変異(SNV)・挿入・欠失(InDel) | 11種類のパネルから選ぶ。Comprehensive cancer panelは275遺伝子、Inherited diseases panelは298遺伝子 | 精製したゲノムDNA・FFPE(パラフィン切片)・cfDNA | 1.5〜2か月(QC通過後1.5か月、データ解析まで含めて2か月。別途パネル試薬の発注に約3週かかる) | |
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GENEWIZ(アゼンタ)
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
がんの種類ごとに19のパネルがある
2
1つあたり約150〜400遺伝子
3
コピー数の変化と再構成まで見える
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記載なし | 精製したDNAを送る | 既製のがんパネル | ハイブリッドキャプチャ法 | 点変異(SNV)・挿入・欠失(InDel)・コピー数の変化(CNV)・融合遺伝子・再構成 | がんの種類(臓器)ごとに19のパネル。1パネルあたり約150〜400遺伝子 | 精製したゲノムDNA・FFPE(パラフィン切片)・組織・細胞 | 記載なし | |
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GENEWIZ(アゼンタ)
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
よく知られたがん遺伝子を約48遺伝子ぶん
2
コピー数の変化や再構成は対象外
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記載なし | 精製したDNAを送る | 既製のがんパネル | アンプリコン法 | 点変異(SNV)・挿入・欠失(InDel) | 約48遺伝子 | 精製したゲノムDNA・FFPE(パラフィン切片)・組織・細胞 | 記載なし | |
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GENEWIZ(アゼンタ)
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
好きな遺伝子を指定して設計する
2
キャプチャ型と独自プライマーから選べる
3
コロニーや綿棒まで検体として受ける
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記載なし | 組織・細胞・血液を送る | カスタム設計 | どちらも選べる | 点変異(SNV)・挿入・欠失(InDel)・コピー数の変化(CNV)・融合遺伝子・再構成 | 記載なし | 精製したゲノムDNA・FFPE(パラフィン切片)・組織・細胞・血液・そのほか(コロニー・綿棒・PCR産物など) | 記載なし | |
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ユーロフィンジェノミクス
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
自分で設計したライブラリーから頼める
2
10 nM以上・15 µL以上にプールして送る
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記載なし | 調製済みのライブラリーを送る | 記載なし | 記載なし | 記載なし | 記載なし | 記載なし | 記載なし |
ランキングの決め方:受注数・見積依頼数・価格(参考合計)・見積返信の速さ・ユーザー評価から計算しています。 受注数・見積依頼数・返信の速さ・評価は、受託解析Quick 上での直近12か月の実績です(実績がまだない項目は0点)。 広告(PR)の出稿や手数料の額では変わりません。 くわしく