de novoゲノム解析 受託サービス比較
参照配列のない生物のゲノムを一から組み立てるサービスです。
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de novoゲノム解析（参照配列のない生物のゲノム構築）
同じ「de novo」でも相手にする生物でまったく別の仕事になります。細菌や古細菌はゲノムが数Mbと小さいので、1本の環状につなぎ切る（コンプリート）ことを狙え、プラスミドまで分けられ、費用も納期も読みやすいです。いっぽう真菌・植物・動物はゲノムが大きく繰り返し配列も多倍体もあるため、contigまでにするか染色体レベルまで組むかで必要なデータ量も費用も桁が変わります。2つめは読み方で、PacBio HiFiは長くて正確ないまの中心技術、ナノポアはさらに長く読めて繰り返し配列をまたげ、イルミナはゲノムサイズの推定や組んだ配列の磨き上げに併用します。どれか1つではなく組み合わせるサービスが多いです。3つめは、配列を組むところまでか、遺伝子予測や機能アノテーションまで含むかです。FASTAだけ受け取っても、そこから先は自分でやることになります。
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各社の公開情報から計算した参考価格です。正式な金額は各社の見積で確認してください。
税区分は各社の表記によります。
「起点」は基本料金に含まれる最初の工程です
（起点が違うと、同じ金額でも含まれる作業が違います）。
料金を公開していない会社も「要見積」として並べています。
表の見出しの文字を押すと、その列で並べ替えられます
（もう一度押すと逆の順）。
記載なしは、いつも最後に並びます。
登録企業は、受託解析Quick 上で見積に直接回答します（未登録の会社にも依頼できます）。
表は左右にスクロールして詳細を比較できます。
| 見積 | 会社・サービス | ランキング ▲ | 参考合計（1検体） | 基本料金（単価） | 製品の特徴 | 最低検体数 | 起点 | 使うシーケンサー | 到達するレベル | 対象の生物 | 含まれる解析 | 必要なDNA量・品質 | 納期 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
ノボジーン
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
イルミナ・ナノポア・PacBioの3つを持つ
2
案件に合わせて組み合わせられる
3
非モデル生物や比較ゲノム研究にも対応
|
記載なし | 精製したゲノムDNAを送る | イルミナ（サーベイ・磨き上げ）・ナノポア（さらに長く読める）・PacBio HiFi（長くて正確） | 記載なし | 植物・動物・細菌・古細菌 | 比較ゲノム | 記載なし | 記載なし | |
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GENEWIZ（アゼンタ）
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
植物・動物・細菌・ウイルスまで幅広く受ける
2
小規模なゲノムなら納期1週間から
|
記載なし | 精製したゲノムDNAを送る | イルミナ（サーベイ・磨き上げ）・PacBio HiFi（長くて正確） | 記載なし | 植物・動物・細菌・古細菌・ウイルス | 記載なし | 記載なし | 1週（小規模なゲノムは1週間より。大きなゲノムの納期は記載なし） | |
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マクロジェン・ジャパン
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
参照配列が未知の生物を新規に配列決定
2
細菌はPacBio Revioで0.2 Gb取るプラン例
|
記載なし | 精製したゲノムDNAを送る | PacBio HiFi（長くて正確）・イルミナ（サーベイ・磨き上げ） | contigまで | 細菌・古細菌 | 遺伝子予測・機能アノテーション | 記載なし | 記載なし | |
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Rhelixa
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
精度の評価や遺伝子構造の予測まで含む
2
RNA-seqを使ったアノテーションも含む
3
生データだけのプランは6〜8週
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記載なし | 精製したゲノムDNAを送る | PacBio HiFi（長くて正確） | contigまで | 記載なし | アセンブリの精度評価・遺伝子予測・機能アノテーション・RNA-seqを使ったアノテーション | 記載なし | 6〜8週（生データプランの納期（検体の受領日から）。アセンブルプランの納期は記載なし） | |
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タカラバイオ
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— | 要見積（基本料金が非公開） | 要見積 |
1
ゲノムサイズごとの推奨冗長度を公開
2
組織・菌体・酵母から送ればDNA抽出も頼める
3
必要なDNAは13 µg以上と多い
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記載なし | 組織・菌体を送る（DNA抽出から） | PacBio HiFi（長くて正確） | 記載なし | 記載なし | ゲノムサーベイ（K-mer）・遺伝子予測・機能アノテーション | 13 µg以上、50 ng/µL以上。OD260/280が1.6以上。50 kb以上に明瞭なバンドが見え、分解や低分子の混入がないこと | 記載なし | |
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ゲノムリード
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— | ¥200,000 税抜 | ¥200,000/検体 |
1
1本の環状ゲノムにつなぎ切るまで明示
2
薬剤耐性プラスミドも網羅的に配列決定
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記載なし | 精製したゲノムDNAを送る | ナノポア（さらに長く読める）・イルミナ（サーベイ・磨き上げ） | 微生物の完全環状ゲノム | 細菌・古細菌 | 遺伝子予測・機能アノテーション | 記載なし | 3〜4か月（通常納期は3〜4か月。急ぎ（1か月以内）と、コンプリート保証プラン（3〜4か月〜半年）は別料金） |
ランキングの決め方：受注数・見積依頼数・価格（参考合計）・見積返信の速さ・ユーザー評価から計算しています。 受注数・見積依頼数・返信の速さ・評価は、受託解析Quick 上での直近12か月の実績です（実績がまだない項目は0点）。 広告（PR）の出稿や手数料の額では変わりません。 くわしく
