SERVICE DETAILS
タカラバイオ： de novoゲノム解析（PacBio HiFi）
タカラバイオが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方：
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
ゲノムサイズごとに推奨する冗長度とアセンブラを公開している数少ないサービス。組織・菌体・酵母から送ればDNA抽出も頼める。必要なDNAは13 µg以上と多い。
参考合計 （1検体）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積（基本料金が非公開）
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析する検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 （必須） | de novoゲノム解析 | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | de novo ゲノム解析（タカラバイオ株式会社） （公式） | 公開価格なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
de novoゲノム解析（参照配列のない生物のゲノム構築）
参照配列のない生物のゲノムを一から組み立てるサービスです。同じ「de novo」でも相手にする生物でまったく別の仕事になります。細菌や古細菌はゲノムが数Mbと小さいので、1本の環状につなぎ切る（コンプリート）ことを狙え、プラスミドまで分けられ、費用も納期も読みやすいです。いっぽう真菌・植物・動物はゲノムが大きく繰り返し配列も多倍体もあるため、contigまでにするか染色体レベルまで組むかで必要なデータ量も費用も桁が変わります。2つめは読み方で、PacBio HiFiは長くて正確ないまの中心技術、ナノポアはさらに長く読めて繰り返し配列をまたげ、イルミナはゲノムサイズの推定や組んだ配列の磨き上げに併用します。どれか1つではなく組み合わせるサービスが多いです。3つめは、配列を組むところまでか、遺伝子予測や機能アノテーションまで含むかです。FASTAだけ受け取っても、そこから先は自分でやることになります。
| 基本料金の起点 | 組織・菌体を送る（DNA抽出から） 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 読み方と到達レベル | |
| 使うシーケンサー 組み合わせることが多い。長く読めるほど繰り返し配列をまたげる | PacBio HiFi（長くて正確） |
| 到達するレベル | 記載なし |
| 使うアセンブラ | 20 Mbまでは Flye、100 Mbまでは IPA、100 Mb超は Hifiasm |
| 推奨する冗長度・データ量 | 20 Mbまでは約50倍、100 Mbまでは約50倍、100 Mb超は約20倍の冗長度を推奨 |
| 対象の生物 | |
| 対象の生物 | 記載なし |
| 対象の生物の補足 | 微生物から高等生物まで豊富な実績と記載（具体的な種の記載はなし） |
| 含まれる解析 | |
| 含まれる解析 | ゲノムサーベイ（K-mer）・遺伝子予測・機能アノテーション |
| 解析の中身の補足 | PacBioのHiFiリードを使う。K-merゲノムプロファイルが納品物に含まれる。遺伝子予測解析（CDSと非コード領域の予測、アノテーション）はオプション |
| 送るもの | |
| 必要なDNA量・品質 | 13 µg以上、50 ng/µL以上。OD260/280が1.6以上。50 kb以上に明瞭なバンドが見え、分解や低分子の混入がないこと |
| DNA抽出 | 検体からのDNA抽出も頼める |
| 試料の注意 | 組織・菌体・酵母は40 mg以上（100 mg程度を推奨）。ゲノムDNAで送る場合は上記の量・濃度を満たすこと |
| 納品と納期 | |
| 納品されるもの | 生データ（FASTQ・BAM）・組み上がった配列（FASTA）・報告書 |
| 納期 | 記載なし |
| 実施する場所 | 国内 |
| 受注の条件・補足 | ゲノムDNA抽出と遺伝子予測解析はオプション。納品は作業報告書、シーケンスデータ、アセンブル結果、K-merゲノムプロファイル |
| 料金の補足 | 依頼の内容により異なるため問い合わせ。なおPacBio相乗りプランの資料に20万円／検体という参考価格の記載があるが、その資料（de_novo_genome.pdf）は取得できず現行の価格か確認できなかったため、ここには入れていない |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
-
確認日 2026-10-05
実施機関の自社ページ
