SERVICE DETAILS
マクロジェン・ジャパン： de novo解析（WGS）
マクロジェン・ジャパンが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方：
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
参照配列が未知の生物を新規に配列決定する解析。細菌のプラン例として、PacBio Revioで0.2 Gb取り、アセンブルとアノテーションまでという構成が公開されている。
参考合計 （1検体）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積（基本料金が非公開）
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析する検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 （必須） | de novo解析 | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | Whole Genome Sequence（WGS）（マクロジェン・ジャパン） （公式） | 公開価格なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
de novoゲノム解析（参照配列のない生物のゲノム構築）
参照配列のない生物のゲノムを一から組み立てるサービスです。同じ「de novo」でも相手にする生物でまったく別の仕事になります。細菌や古細菌はゲノムが数Mbと小さいので、1本の環状につなぎ切る（コンプリート）ことを狙え、プラスミドまで分けられ、費用も納期も読みやすいです。いっぽう真菌・植物・動物はゲノムが大きく繰り返し配列も多倍体もあるため、contigまでにするか染色体レベルまで組むかで必要なデータ量も費用も桁が変わります。2つめは読み方で、PacBio HiFiは長くて正確ないまの中心技術、ナノポアはさらに長く読めて繰り返し配列をまたげ、イルミナはゲノムサイズの推定や組んだ配列の磨き上げに併用します。どれか1つではなく組み合わせるサービスが多いです。3つめは、配列を組むところまでか、遺伝子予測や機能アノテーションまで含むかです。FASTAだけ受け取っても、そこから先は自分でやることになります。
| 基本料金の起点 | 精製したゲノムDNAを送る 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 読み方と到達レベル | |
| 使うシーケンサー 組み合わせることが多い。長く読めるほど繰り返し配列をまたげる | PacBio HiFi（長くて正確）・イルミナ（サーベイ・磨き上げ） |
| 到達するレベル | contigまで |
| 使うアセンブラ | 記載なし |
| 推奨する冗長度・データ量 | 細菌のプラン例でPacBio Revio 0.2 Gb／検体が目安 |
| 対象の生物 | |
| 対象の生物 | 細菌・古細菌 |
| 対象の生物の補足 | 公開されているプラン例は細菌。ほかの生物種の記載はなし |
| 含まれる解析 | |
| 含まれる解析 | 遺伝子予測・機能アノテーション |
| 解析の中身の補足 | 解析生物種の参照配列などが未知で、新規にゲノム配列決定を行うための解析と説明されている。アセンブリとアノテーションの付与ができる |
| 送るもの | |
| 必要なDNA量・品質 | 記載なし |
| DNA抽出 | 記載なし |
| 試料の注意 | 記載なし |
| 納品と納期 | |
| 納品されるもの | 生データ（FASTQ・BAM）・組み上がった配列（FASTA）・遺伝子予測・アノテーションの結果 |
| 納期 | 記載なし |
| 実施する場所 | 国内・海外 |
| 受注の条件・補足 | 細菌のプラン例はSMRTbell prep kit 3.0 Microbial Library Kitを使い、ダウンロードで納品。必要なDNA量、納期、価格、納品ファイルの形式はこのページに記載がない |
| 料金の補足 | 公開価格なし |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-10-05
実施機関の自社ページ。de novo解析の説明と細菌のプラン例
