ダナフォーム： CAGE-seq受託解析（Cap-trap・PCRなし）
ダナフォームが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
このサービスについて
RNAの5'末端のキャップをビオチン化して釣り上げる方法で、ライブラリー作製からPCRの増幅工程を完全に外している。増幅の偏りが乗らないので量をそのまま比べられる。データ解析込みで9〜11万円。
参考合計 （4検体）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
| 内訳 | 単価 | 数量 | 小計 | 税 | 価格の出典 |
|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 CAGE-seq受託解析（データ解析込み） | ¥90,000〜¥110,000/検体 | 4 | ¥360,000 | 記載なし | よくあるお問い合わせ（株式会社ダナフォーム） （公式） |
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析する検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 （必須） | CAGE-seq受託解析（データ解析込み） | ¥90,000〜¥110,000/検体 | — | 記載なし | 通常 | よくあるお問い合わせ（株式会社ダナフォーム） （公式） | FAQの「9〜11万円」という記載。税の表記はなく、1検体あたりかどうかもFAQに明記がない |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
RNAの5'末端だけを読んで、どこから転写が始まったか（転写開始点、TSS）を1塩基の精度で決める解析です。通常のRNA-seqが転写物の全体を読むのに対し、CAGEは5'末端に絞るため、プロモーターの活性をゲノム全体で定量でき、転写物の長さによる偏りも乗りません。エンハンサーRNAの同定や転写因子結合モチーフの探索にも使えます。国内で受託しているのは1社だけなので、比べるのは会社どうしではなく2つの方式になります。CAGEはキャップ構造をビオチン化して釣り上げる方法で、ライブラリー作製からPCRの増幅工程を完全に外しているため量をそのまま比べられますが、total RNAが3 µg要ります。nanoCAGEはプライマーの工夫と特異的な増幅でナノグラム単位から作れますが、PCRの工程が入るぶん増幅の偏りが乗ります。手元のRNA量と、定量の正確さをどこまで求めるかで選ぶことになります。
| 基本料金の起点 | 精製したtotal RNAを送る 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 方式 | |
| 方式 ここが分かれ目。必要なRNA量と、量の比べやすさが入れ替わる | CAGE（Cap-trap） |
| PCRの増幅工程 PCRが入ると増幅の偏りが乗る。入らなければ量をそのまま比べられる | なし（増幅の偏りが乗らない） |
| 使う装置 | 記載なし |
| 取れるリード数 | 記載なし |
| わかること | |
| 調べられること | 転写開始点（TSS）の同定・プロモーター活性の定量・エンハンサーRNAの同定・転写因子結合モチーフの探索・発現変動・GO解析 |
| 調べられることの注意 | RNAの5'末端に付加されるキャップ構造を特異的にビオチン化して回収する（Cap-trap法）。ゲノムワイドにプロモーター活性を定量解析できる技術で、双方向のエンハンサーRNAの同定、転写因子結合モチーフの探索にも使える。発現変動解析（Alternative Transcription Start Sites）、CAGEクラスター、発現解析レポート、モチーフ探索の結果とヒートマップが解析メニューとして挙げられている。GO探索の結果は納品データに含まれる |
| 送るもの | |
| 必要なRNA量 | total RNA 3 µg以上 |
| RINの下限 | 7 |
| 試料の注意 | A260/A280とA260/A230がともに1.8以上。RNaseフリー水に溶かし、濃度は0.1〜1.0 µg/µL |
| 対象の生物種 | ヒト、マウス、サル、ラット、イヌ、ウシ、ヒツジ、ブタ、ニワトリ、カエル、ゼブラフィッシュ、ショウジョウバエ、ウニ、線虫、酵母、カビ、ウイルス、植物など多数に対応と記載 |
| 納品と納期 | |
| 納期 | 1〜2か月（通常1〜2か月。年度の後半（10月〜3月）は依頼が集中するため1〜2週間余計にかかることがある） |
| 実施する場所 | 国内 |
| 受注の条件・補足 | PCRによる増幅工程をライブラリー作製過程から完全に排除していると説明されている。見積のフォームでは、ライブラリー作製だけ、シーケンスまで、基本的な情報解析まで、といった範囲を選べる |
| 料金の補足 | FAQに「9〜11万円と、RNA-seqと同程度です」（データ解析込み）とある。RNA-seqの相場と並べた言い方なので1検体あたりと読んだが、FAQの文面に単位の明記はない。見積のときに確かめること |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-10-05
実施機関の自社ページ。方式と解析の内容はここ
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確認日 2026-10-05
必要RNA量、試料条件、価格、納期はこのFAQの記載
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CAGE解析（株式会社ダナフォーム） （公式）確認日 2026-10-05
解析メニューの内容
