京都大学 ASHBi SignAC: PacBio Iso-Seq
京都大学 ASHBi SignACが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
このサービスについて
Revioで全長アイソフォームを読む。必要なRNAは700 ngからと、この分類でいちばん少ない。1サンプル・1セルあたり525,400円(学外アカデミア・税込)。
参考合計 (2検体)
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
| 内訳 | 単価 | 数量 | 小計 | 税 | 価格の出典 |
|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 PacBio Iso-Seq(1サンプル・1セル・学外アカデミア) | ¥525,400/検体 | 2 | ¥1,050,800 | 税込 | 料金表(京都大学ASHBi SignAC) (公式) |
登録されている料金(すべて)
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析する検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 (必須) | PacBio Iso-Seq(1サンプル・1セル・学外アカデミア) | ¥525,400/検体 | — | 税込 | 通常 | 料金表(京都大学ASHBi SignAC) (公式) | 1サンプル・1セルあたりの価格。企業研究者は794,400円 |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
転写物を端から端まで1本で読むサービスです。ショートリードのRNA-seqは転写物を断片にして読むため、同じ遺伝子から出ているどのアイソフォームの断片なのかが分からなくなりますが、ロングリードなら5'末端からポリAまでつながった全長のアイソフォームがそのまま取れます。いちばん大きな分かれ目は読み方です。PacBioのIso-SeqはcDNAにしてから1本ずつ正確に読む定番で、Kinnexは1本のリードに複数の転写物をつないで読む高スループット版です。ナノポアのdirect RNAは逆転写もPCRもせずRNAをそのまま読むので、PCRの偏りがなく塩基の修飾やポリAの長さも見えますが、必要なRNA量は多くなります。2つめがその必要量で、PacBioは700 ngから1.2 µg程度、ナノポアのdirect RNAは2.5から5.5 µgと桁がひとつ違うことがあり、手元の量で読み方が決まってしまいます。3つめはわかることで、新規アイソフォームの検出、選択的スプライシング、融合遺伝子、ゲノムのアノテーション、アイソフォーム別の発現定量のどこまで含むかが会社で違います。
| 基本料金の起点 | 精製したRNAを送る 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 読み方 | |
| 読み方 ここが最初の分かれ目。必要なRNA量も、見えるものも、値段も変わる | PacBio Iso-Seq |
| 使う装置・キット | PacBio Revio(Iso-Seqライブラリーキット) |
| 取れるリード数 | 1セルあたり600万〜800万リード(Revio。データ量の保証はない) |
| わかること | |
| 調べられること | 全長アイソフォームの決定 |
| 調べられることの注意 | シーケンスまでのサービス。一次解析(QC、マッピングなど)については問い合わせと書かれている |
| 送るもの | |
| 必要なRNA量 | 700 ng以上、濃度60 ng/µL以上 |
| RINの下限 | 7 |
| 試料の注意 | 記載なし |
| 対象の生物種 | 記載なし |
| 納品と納期 | |
| 納品されるもの | 生データ(BAM・FASTQ・POD5) |
| 納期 | 2〜3週(キットの在庫があれば2〜3週、無ければ3〜4週) |
| 実施する場所 | 国内 |
| 受注の条件・補足 | 学外からも依頼できる。納品は hifi_reads.bam ファイル。同じ施設に高スループット版のKinnex(全長RNA)のメニューもある。申込はKUMaCoまたはShare-eでの予約 |
| 料金の補足 | 1サンプル・1セルあたりの価格(消費税込み)。学外アカデミア研究者 525,400円、企業研究者 794,400円、非営利・学外 495,600円 |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-10-05
実施機関のページ。試料条件、リード数、納期はここ
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確認日 2026-10-05
利用者区分ごとの価格。消費税を含む