タカラバイオ: ロングリードRNA-Seq解析(Iso-Seq)
タカラバイオが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
このサービスについて
PacBioのロングリードで全長アイソフォームを決める。新規アイソフォームの検出とアイソフォームごとの発現量解析まで含む。必要なtotal RNAは1 µg以上と、この分類では少ないほう。
参考合計 (2検体)
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
登録されている料金(すべて)
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析する検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 (必須) | ロングリードRNA-Seq解析(Iso-Seq) | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | ロングリードRNA-Seq解析(タカラバイオ株式会社) (公式) | 公開価格なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
転写物を端から端まで1本で読むサービスです。ショートリードのRNA-seqは転写物を断片にして読むため、同じ遺伝子から出ているどのアイソフォームの断片なのかが分からなくなりますが、ロングリードなら5'末端からポリAまでつながった全長のアイソフォームがそのまま取れます。いちばん大きな分かれ目は読み方です。PacBioのIso-SeqはcDNAにしてから1本ずつ正確に読む定番で、Kinnexは1本のリードに複数の転写物をつないで読む高スループット版です。ナノポアのdirect RNAは逆転写もPCRもせずRNAをそのまま読むので、PCRの偏りがなく塩基の修飾やポリAの長さも見えますが、必要なRNA量は多くなります。2つめがその必要量で、PacBioは700 ngから1.2 µg程度、ナノポアのdirect RNAは2.5から5.5 µgと桁がひとつ違うことがあり、手元の量で読み方が決まってしまいます。3つめはわかることで、新規アイソフォームの検出、選択的スプライシング、融合遺伝子、ゲノムのアノテーション、アイソフォーム別の発現定量のどこまで含むかが会社で違います。
| 基本料金の起点 | 精製したRNAを送る 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 読み方 | |
| 読み方 ここが最初の分かれ目。必要なRNA量も、見えるものも、値段も変わる | PacBio Iso-Seq |
| 使う装置・キット | PacBio ロングリードシーケンサー(パシフィックバイオサイエンス社) |
| 取れるリード数 | 記載なし |
| わかること | |
| 調べられること | 全長アイソフォームの決定・新規アイソフォームの検出・アイソフォーム別の発現定量・ゲノムのアノテーション |
| 調べられることの注意 | 公式ページに書かれているのは、アイソフォームの配列決定、新規アイソフォームの検出、アイソフォームごとの発現量解析、納品データとしてのアノテーション結果まで。選択的スプライシングと融合遺伝子については記載なし |
| 送るもの | |
| 必要なRNA量 | total RNA 1 µg以上、濃度100 ng/µL以上 |
| RINの下限 | 記載なし |
| 試料の注意 | 記載なし |
| 対象の生物種 | ポリA+のRNAがない原核生物は別途相談と記載 |
| 納品と納期 | |
| 納品されるもの | 生データ(BAM・FASTQ・POD5)・マッピング結果・発現・アノテーション結果・作業報告書 |
| 納期 | 記載なし |
| 実施する場所 | 国内 |
| 受注の条件・補足 | 納品は作業報告書、シーケンスデータ一式、解析データ一式(マッピング結果ファイル、発現情報・アノテーション結果ファイル) |
| 料金の補足 | 依頼の内容により異なるため問い合わせ |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-10-05
実施機関の自社ページ