GENEWIZ（アゼンタ）： 菌種同定サンガーシーケンス（16S V1–V9全長・真菌ITS）

単離して純粋培養した菌株を送ると、rRNAの配列を読んでデータベースと照らし、近縁種を返してくれるサービスです。混ざったままの試料を読む菌叢解析とは別のもので、どの会社も純粋培養された株であることを条件にしています。価格より先に見たいのは、どこまで読むかです。細菌の16Sは部分配列（約750 bp）でも属まで決まることが多いのですが、近縁種が多い属では種まで決まりません。全長（約1,500 bp）まで読むと分離能が上がります。真菌はITSが標準で、酵母では28S/26SのD1/D2も使われます。つぎに、何を送れるかです。シャーレのまま送れるのか、抽出ずみのDNAでないと受けてもらえないのかで手間が変わります。病原性の可能性がある菌は、菌体では受け付けずDNAにしてから送るよう求める会社が多いです。3つめは生データをもらえるかどうかで、波形（ab1）とつなげた配列（contig）があれば、あとから自分でBLASTをかけ直せますし、論文や菌株登録にも使えます。