SERVICE DETAILS
北海道システム・サイエンス： 微生物同定（16S・ITSの両鎖サンガー）
北海道システム・サイエンスが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方：
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
細菌は16S（10F-800R）、真菌はITS（ITS1F-ITS1R）を両鎖で。日本薬局方の迅速同定法に基づく。波形とアセンブリまで納品。料金は要見積。
参考合計 （3菌株）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積（基本料金が非公開）
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 同定する菌株の数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 （必須） | 微生物同定（1菌株） | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | 微生物同定 （公式） | 公式ページに料金の記載なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
菌種同定（純粋培養した菌株のrRNA配列による同定）
単離して純粋培養した菌株を送ると、rRNAの配列を読んでデータベースと照らし、近縁種を返してくれるサービスです。混ざったままの試料を読む菌叢解析とは別のもので、どの会社も純粋培養された株であることを条件にしています。価格より先に見たいのは、どこまで読むかです。細菌の16Sは部分配列（約750 bp）でも属まで決まることが多いのですが、近縁種が多い属では種まで決まりません。全長（約1,500 bp）まで読むと分離能が上がります。真菌はITSが標準で、酵母では28S/26SのD1/D2も使われます。つぎに、何を送れるかです。シャーレのまま送れるのか、抽出ずみのDNAでないと受けてもらえないのかで手間が変わります。病原性の可能性がある菌は、菌体では受け付けずDNAにしてから送るよう求める会社が多いです。3つめは生データをもらえるかどうかで、波形（ab1）とつなげた配列（contig）があれば、あとから自分でBLASTをかけ直せますし、論文や菌株登録にも使えます。
| 基本料金の起点 | 菌株を送る 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 読む領域 | |
| 対象の微生物 | 細菌・カビ |
| 読む領域 16Sは部分配列でも属までは決まることが多い。種まで絞りたいときは全長 | 16S rRNA（部分配列）・ITS（真菌・酵母） |
| 読む長さ | 記載なし |
| 使うプライマー | 細菌は16S rRNA領域の10F／800R、真菌はITS領域のITS1F／ITS1R |
| 読む向き | 両鎖 |
| 使う装置 | 3730xl DNA Analyzer |
| 送る菌株 | |
| 受け付ける形 | 寒天培地（シャーレ）・菌体ペレット・抽出ずみのDNA |
| DNAを送るときの条件 | PCRができる精製レベル |
| 病原性の菌の扱い | 菌体は不可（抽出ずみDNAなら相談） |
| 受注の条件・補足 | 必ず純粋培養された菌株を送る（菌の単離作業は行っていない）。病原性の菌体は受け入れておらず、DNAを抽出した状態で依頼する。日本薬局方の「遺伝子解析による微生物の迅速同定法」に基づいて実施する。既知の配列との相同性検索の結果を報告する |
| 納品と納期 | |
| 納品されるもの | 波形データ（ab1）・つなげた配列（contig）・BLASTの結果・同定レポート |
| 納期 | 記載なし |
| 解析する場所 | 国内 |
| 料金の補足 | 要見積 |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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微生物同定 （公式）確認日 2026-10-04
料金・納期の記載はない
