SERVICE DETAILS
KOTAIバイオテクノロジーズ： シングルセル・空間トランスクリプトームのデータ解析
KOTAIバイオテクノロジーズが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
ご注文の受け方：
代理店経由
研究室が指定する代理店を介してのご注文となります。
このサービスについて
他施設で取ったデータも受ける。Visium HD・Xeniumにも対応。RDSとパラメータ、論文Methods用の文章例まで納品。料金は要見積。
参考合計 （6サンプル）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
参考価格
要見積（基本料金が非公開）
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 解析するサンプル数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 （必須） | シングルセル・空間トランスクリプトームのデータ解析 | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | シングルセルRNA-seq・空間トランスクリプトームデータ解析 （公式） | データの種類と解析内容によって変わる |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
NGSデータ解析（取得ずみのシーケンスデータを渡して、解析だけを頼む受託）
すでに読み終わったシーケンスデータを渡して、バイオインフォマティクス解析だけをやってもらうサービスです。自分のところで読んだデータ、共同研究者からもらったデータ、公共データベースから落としたデータが対象になります。価格より先に見たいのは、どの解析に対応しているかです。バルクRNA-seqだけの会社と、WGS・WES・ATAC-seq・ChIP-seq・シングルセルまで横断する会社があります。つぎに、何を渡せるかです。FASTQから受ける会社が多いのですが、BAMやcount matrix、Cell Rangerの出力から受けてくれるところもあり、手元にあるものがそのまま渡せるかで手間が変わります。3つめは、あとから自分で再現できるかどうかです。解析スクリプトやパラメータの設定値をもらえれば、論文のMethodsが書けますし、査読で条件を変えて出し直すときも自分で回せます。図と表だけだと、そこで止まります。
| 基本料金の起点 | 取得ずみのデータを送る 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 対応する解析 | |
| 解析できるデータ 1社で何種類まで見てもらえるか。横断している会社なら、別の実験も同じところに頼める | シングルセルRNA-seq・空間トランスクリプトーム |
| やってもらえる解析 | データのQC・フィルタリング・次元削減・クラスタリング（PCA・UMAP）・細胞タイプのアノテーション・変動遺伝子解析（群間比較）・GO・パスウェイ・GSEA・擬似系譜（トラジェクトリ）・細胞間相互作用 |
| 解析の補足 | 標準はQC・フィルタリング、複数サンプルの統合と次元削減（UMAP）、クラスタリング、各クラスタのマーカー遺伝子の同定、細胞アノテーション、変動遺伝子解析（群間比較）、Gene Ontology解析（ヒト・マウスのみ）。VDJレパトア解析、細胞間相互作用解析、擬似系譜（トラジェクトリ）解析はオプション |
| 生物種 | ヒト・マウスが中心（ほかは相談） |
| 渡すデータ | |
| 受け付ける入力 手元にあるものがそのまま渡せるか。渡せないと、自分で変換する手間がかかる | 記載なし |
| 解析だけの依頼 他社や自分のところで読んだデータでも受けてくれるか | 受け付けると明記 |
| データの条件 | 記載なし |
| 納品と再現性 | |
| 納品されるもの | 解析レポート・報告書・図表（UMAP・volcano・ヒートマップなど）・中間ファイル（BAM・VCF・RDSなど） |
| あとから自分で再現するための情報 論文のMethodsを書くときと、査読で条件を変えて出し直すときに効く | 解析のパラメータ・設定値・論文Methods用の文章例 |
| 納品後のやりとり | 記載なし |
| 使うソフト | 記載なし |
| 納期と場所 | |
| 納期 | 記載なし |
| 解析する場所 | 国内 |
| 受注の条件・補足 | 自社で取ったデータに限らず、他施設で取得したシングルセル（核）RNAシーケンスデータや空間トランスクリプトームデータも受け付ける。プラットフォームはシングルセル（核）RNA-seq、Visium HD、Xenium |
| 料金の補足 | データの種類と解析内容によって変わるため問い合わせ |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-10-04
