メディカル・プロテオスコープ： 糖鎖結合部位の同定（Nグリコシル化部位同定）
メディカル・プロテオスコープが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、
内容に応じて見積依頼をしてください。
このサービスについて
国内の受託。冷アセトン（−25℃で一晩）で糖ペプチドだけを集めてから、PNGase Fで糖鎖を外し、AsnがAspに変わったところをN型糖鎖の結合部位として決める。糖鎖そのものの情報は出ないが、そのぶんサイトの同定に集中できる方式。装置はQ Exactive（Thermo Fisher Scientific）とUltimate 3000 RSLCnano、解析はMascot Server 2.8とProteome Discoverer 3.0。納品は分析報告書と、同定結果・計量値の表計算ファイル。
参考合計 （1検体）
公開されている料金をもとに計算した参考金額です。
登録されている料金（すべて）
基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。
| 区分 | 内容 | 金額 | 検体数の条件 | 税 | 種類・期間 | 出典 | メモ |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 基本料金 （必須） | 糖鎖結合部位の同定（1検体） | 要見積 | — | 記載なし | 通常 | 糖鎖結合部位の同定（メディカル・プロテオスコープ） （公式） | 公式ページに価格の記載なし |
仕様
掲載されている解析条件・サービス仕様です。
糖タンパク質を酵素で切って糖ペプチドにし、質量分析で「どのアミノ酸に糖鎖が付いているか」「そのサイトにどんな糖鎖が付いているか」を調べる受託です。糖鎖を外してから構造を決める解析（N型糖鎖解析・O型糖鎖解析）とは別で、こちらは結合部位の情報が残ります。選ぶときの分かれ目は3つ。ひとつめは測り方で、糖鎖を外さずそのまま測るか（intact glycopeptide）、糖鎖を外してサイトだけ決めるか、サイトごとに切り出してから糖鎖を測るかで、出てくるものがまったく違います。ふたつめはN型だけかO型も見るかで、O型の位置を決めるにはETD・EThcD・EADのようなフラグメンテーションが要ります。みっつめは単一の精製タンパク質が対象か、試料全体を網羅するかです。この分類は価格を公開している会社がほとんどないので、まず技術で絞ってから見積を取ってください。
| 基本料金の起点 | タンパク質・生体試料から（消化・濃縮・測定まで） 基本料金に含まれる最初の工程 |
|---|---|
| 何が分かるか | |
| 測り方の考え方 同じ「糖鎖結合部位が分かる」でも、出てくるものが違います | 糖鎖を外してサイトだけ決める |
| 見られる糖鎖 | N型糖鎖 |
| 解析の規模 | 記載なし |
| 報告される内容 | 糖鎖の結合部位 |
| 同定できる数の目安 | 記載なし |
| 測り方 | |
| 装置 | 質量分析計：Q Exactive 四重極-Orbitrap質量分析計（Thermo Fisher Scientific）。 液体クロマトグラフ：Ultimate 3000 RSLCnano System（Thermo Fisher Scientific）。 |
| フラグメンテーション O型糖鎖の結合位置を決めるには、糖鎖を付けたまま切れるETD・EThcD・EADが要ります | 記載なし |
| 消化 | トリプシンなどの加水分解酵素 |
| 糖ペプチドの濃縮・分画 | 冷アセトン（−25℃で一晩）を使って、糖ペプチド断片を非糖ペプチドから分けて濃縮する。 そのあとN-glycosidase F（PNGase F）で糖鎖を外す。 |
| 解析ソフト | Mascot Server ver. 2.8（Matrix Science）、Proteome Discoverer ver. 3.0（Thermo Fisher Scientific） |
| 確認・品質管理 | 記載なし |
| 送る試料 | |
| 対応する試料 | 記載なし |
| 必要試料量 | 記載なし |
| 試料の注意 | 記載なし |
| 報告・納期・料金 | |
| 納品されるもの | 報告書・数値データ（表計算ファイル） |
| 納期 | 記載なし |
| 実施する場所 | 国内 |
| 認証・規制対応 | 記載なし |
| 受注の条件・補足 | 糖鎖を外してからサイトを決める方式なので、 「どのサイトに、どんな糖鎖が付いていたか」は分からない。 サイトの一覧がほしいときに向く。 打ち合わせはオンラインでもできると書かれている。 |
| 料金の補足 | 公式ページに価格・納期・必要試料量の記載はない。問い合わせになる |
出典
料金・仕様の根拠となる公開情報です。
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確認日 2026-10-02
