SERVICE DETAILS

北海道システム・サイエンス: ゲノムリシーケンス解析(ヒト以外)

北海道システム・サイエンスが提供するサービスです。
ご注文の前に「掲載情報」「料金詳細」「発注条件」などを確認のうえ、 内容に応じて見積依頼をしてください。

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公式ページを開く ↗ 情報確認日 2026-09-29

このサービスについて

ヒト以外の生物の、参照ゲノムを使った全ゲノム解析。Illumina 150PE、ゲノムサイズの×30以上を推奨。マッピング・SNP候補検索/構造変異検索。料金はお問い合わせ。

参考合計 (6検体)

公開されている料金をもとに計算した参考金額です。

参考価格
要見積(基本料金が非公開)

登録されている料金(すべて)

基本料金・オプション・適用条件などの一覧です。

区分 内容 金額 検体数の条件 税 種類・期間 出典 メモ
基本料金 (必須) 基本料金 要見積 — 記載なし 通常 ゲノムリシーケンス解析(ヒト以外) (公式) お問い合わせ(金額は公開されていない)

仕様

掲載されている解析条件・サービス仕様です。

全ゲノム解析(Whole Genome Sequencing, WGS)

ゲノム全体(ヒトなら約30億塩基)を読む解析です。エクソン以外の領域や、構造変異(SV)・コピー数の変化(CNV)も調べられます。ヒトでは90 Gb(約30×)が目安です。動植物・微生物では、ゲノムの大きさで必要なデータ量が変わります。

基本料金の起点 DNAから 基本料金に含まれる最初の工程
対象と読み方
対象生物 動物・植物・微生物
対象生物の補足 ヒト以外(参照ゲノムのある生物)
リードの種類 ショートリードは1塩基の変異に強く、ロングリードは大きな構造変異・繰り返し配列・ゲノムの組み立てに強い ショートリード(Illumina など)
シーケンサー 記載なし
ライブラリ PCR-free は増幅の偏りが少ないが、多くのDNAが必要 PCR-free・PCRありを選べる
ライブラリの補足 PCR-Plus/PCR-Free
データ量
データ量 1検体あたりの読んだ塩基の量(10億塩基単位)。ヒトの90 Gbは約30× 記載なし
カバレッジ ゲノムの同じ場所を平均何回読むか 30 ×
リード長 ショートリードの1本の長さ(PE150なら150) 150 bp
ペアエンド/シングルエンド ペアエンド
データ品質の基準 記載なし
データ量の補足 ゲノムサイズの×30以上を推奨(例:シロイヌナズナ 130 Mb → 4 Gb以上)
検体
必要DNA量 500 ng
必要な濃度 10 ng/µL
必要な液量 30 µL
品質の条件 記載なし
DNAでの受付 受け付ける
FFPEでの受付 ホルマリン固定・パラフィン包埋の組織から取ったDNA 記載なし
菌株・菌体での受付 記載なし
DNA抽出 記載なし
検体の補足 PCR-Plus:DNA 500 ng以上・10 ng/uL以上・30 uL以上/PCR-Free:4 ug以上・50 ng/uL以上・30 uL以上
解析と納品
変異検出(SNV・InDel) SNV=1塩基の置き換わり、InDel=短い挿入・欠失 記載なし
構造変異・コピー数(SV・CNV) SV=大きな欠失・重複・逆位など、CNV=遺伝子の数の増減 記載なし
ゲノムの組み立て(de novo) 参照ゲノムのない生物で、読んだ配列からゲノムを組み立てる 記載なし
納品ファイル FASTQ=読んだ配列、BAM=参照配列に並べたもの、VCF=見つかった変異の一覧 記載なし
納品方法 記載なし
解析の補足 解析メニュー:マッピング・SNP候補検索/マッピング・構造変異検索
納期と解析場所
納期 記載なし
解析を行う場所 記載なし
解析場所の補足 記載なし

出典

料金・仕様の根拠となる公開情報です。