シングルセルRNA-seq 受託サービス比較

細胞を1つずつ分けて、それぞれの細胞でどの遺伝子が働いているかを調べる解析です。

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シングルセルRNA-seq（scRNA-seq・1細胞ごとの遺伝子発現解析）

組織の中にどんな種類の細胞がいて、どの細胞で何が変わったのかが分かります。細胞の状態（新鮮・凍結・固定）や生存率で、使える方式と成功しやすさが変わります。

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税区分は各社の表記によります。「起点」は基本料金に含まれる最初の工程です（起点が違うと、同じ金額でも含まれる作業が違います）。料金を公開していない会社も「要見積」として並べています。表の見出しの文字を押すと、その列で並べ替えられます（もう一度押すと逆の順）。記載なしは、いつも最後に並びます。

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会社・サービス	ランキング ▼	参考合計（6検体）	基本料金（単価）	製品の特徴	最低検体数	起点	方式	受け付ける検体	リード数（1細胞あたり）	料金に含まれる解析	出張・持ち込み	納期
アメリエフシングルセルRNA-seq データ解析＋詳細説明公式サイト情報確認日： 2026-09-28	1	¥1,680,000 税抜	¥280,000/検体キャンペーン中	1 取得済みのデータから解析する 2 詳しく説明してもらえる	記載なし	取得済みデータから（解析のみ）	その他・複数の方式	データ（解析のみ）	記載なし	高次解析まで	記載なし	記載なし
ノボジーン 10x シングルセル3'遺伝子発現解析（海外ラボ・凍結組織）公式サイト情報確認日： 2026-10-09	2	¥2,998,500 税抜	¥498,000/検体キャンペーン中（10/30まで）	1 海外ラボで凍結組織から 2 4億リード／120 Gb 3 Cell Rangerレポートまで	記載なし	組織から（細胞の分散・核抽出を含む）	10x 3'遺伝子発現	凍結組織	記載なし	Cell Rangerまで	出張で実験できる	4週（標準4週間）
KOTAIバイオテクノロジーズシングルセル遺伝子発現RNA-seq（10x Universal 3'）公式サイト情報確認日： 2026-09-28	3	¥5,550,000 税抜	¥925,000/検体	1 凍結細胞から実験・解析まで約6週間 2 最大20,000細胞 3 新鮮な細胞は出張で対応	記載なし	細胞懸濁液から	10x Universal 3'	凍結細胞・新鮮な細胞	20,000 リード	Cell Rangerまで	出張で実験できる	6週（約6週間）
KOTAIバイオテクノロジーズシングルセル遺伝子発現RNA-seq（10x Universal 3' OCM・2〜4検体）公式サイト情報確認日： 2026-09-28	—	要見積（基本料金が非公開）	2〜4検体：¥960,000/一式	1 OCMで2〜4検体を1回の反応にまとめる 2 約6週間	2検体から	細胞懸濁液から	10x OCM（複数検体をまとめて）	凍結細胞・新鮮な細胞	20,000 リード	Cell Rangerまで	出張で実験できる	6週（約6週間）
日本ジェネティクス 10X シングルセルトランスクリプトーム解析パッケージ 120Gb 公式サイト情報確認日： 2026-09-28	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 NovaSeq X Plus（PE150）で120 Gb 2 凍結細胞または新鮮な組織から 3 単細胞化の後8週間から	記載なし	細胞懸濁液から	10x 3'遺伝子発現	凍結細胞・新鮮な組織	記載なし	Cell Rangerまで	記載なし	8週（単細胞化の後8週間〜（解析なしの場合））
ノボジーン 10x シングルセル3'遺伝子発現解析（国内ラボ・柏）公式サイト情報確認日： 2026-10-09	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 柏の国内ラボでChromium iXを使う 2 凍結細胞から4億リード／120 Gb 3 Cell Rangerレポートまで	記載なし	細胞懸濁液から	10x 3'遺伝子発現	新鮮な組織・凍結細胞	記載なし	Cell Rangerまで	出張で実験できる	3週（最短3週間（キャンペーン））
ノボジーン 10x シングルセル3'遺伝子発現解析（海外ラボ・凍結細胞）公式サイト情報確認日： 2026-10-09	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 海外ラボで凍結細胞から 2 4億リード／120 Gb 3 Cell Rangerレポートまで	記載なし	細胞懸濁液から	10x 3'遺伝子発現	凍結細胞	記載なし	Cell Rangerまで	出張で実験できる	4週（標準4週間）
アメリエフシングルセルRNA-seq WET&DRY（OCM・Cell Rangerまで）公式サイト情報確認日： 2026-10-09	—	要見積（基本料金が非公開）	2検体：¥740,000/一式キャンペーン中	1 凍結細胞2検体をOCMでまとめる 2 シーケンス・Cell Rangerまで	記載なし	細胞懸濁液から	10x OCM（複数検体をまとめて）	凍結細胞	記載なし	Cell Rangerまで	記載なし	記載なし
アメリエフシングルセルRNA-seq WET&DRY（OCM・GO／パスウェイ／擬時間解析まで）公式サイト情報確認日： 2026-09-28	—	要見積（基本料金が非公開）	2検体：¥1,300,000/一式キャンペーン中	1 凍結細胞2検体をOCMでまとめる 2 GO・パスウェイ・擬時間解析まで	記載なし	細胞懸濁液から	10x OCM（複数検体をまとめて）	凍結細胞	記載なし	高次解析まで	記載なし	記載なし
タカラバイオシングルセル3' RNA-Seq（10x Chromium X）公式サイト情報確認日： 2026-09-28	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 Chromium Xで3'ライブラリを作る 2 凍結・新鮮細胞や凍結組織・FFPEに対応 3 幅広い生物種に対応	記載なし	細胞懸濁液から	10x 3'遺伝子発現	凍結細胞・新鮮な細胞・凍結組織・固定サンプル・FFPE	記載なし	Cell Rangerまで	記載なし	記載なし
マクロジェン・ジャパン Single Cell RNA Sequence（10x Flex・固定サンプル）公式サイト情報確認日： 2026-09-28	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 固定した細胞・組織やFFPEから 2 Chromium Fixed RNA Kitで解析 3 固定から解析まで一貫で平均1〜1.5か月	記載なし	組織から（細胞の分散・核抽出を含む）	10x Flex（固定サンプル）	固定サンプル・FFPE	記載なし	Cell Rangerまで	記載なし	1〜1.5か月（サンプル到着からRaw data納品まで（平均））
Rhelixa シングルセル 3'RNA-seq（10x Genomics）公式サイト情報確認日： 2026-09-28	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 条件検討の支援がつく 2 OCMで最大4検体・合計20,000細胞 3 細胞種の推定やRNA velocityまで	記載なし	細胞懸濁液から	10x 3'遺伝子発現	新鮮な細胞・凍結細胞	記載なし	Cell Rangerまで	記載なし	記載なし
GENEWIZ（アゼンタ）シングルセルRNAシーケンス解析（10x Chromium）公式サイト情報確認日： 2026-09-28 直接取引のみ	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 細胞からライブラリまでどの段階でも依頼できる 2 新鮮な組織の分散や凍結組織からの核抽出 3 死細胞除去にも対応	記載なし	細胞懸濁液から	10x 3'遺伝子発現	新鮮な組織・凍結組織・新鮮な細胞・凍結細胞・核・cDNA・ライブラリ	記載なし	記載なし	記載なし	記載なし
ジエンブルシングルセルRNA-seq解析（共同研究型受託）公式サイト情報確認日： 2026-09-28	—	要見積（基本料金が非公開）	要見積	1 10x ChromiumやBD Rhapsodyから選ぶ 2 実験計画から解釈まで支援する 3 FASTQからの解析のみもできる	記載なし	細胞懸濁液から	その他・複数の方式	新鮮な細胞・凍結細胞・データ（解析のみ）	記載なし	クラスタリング・マーカー遺伝子まで	出張で実験できる	記載なし

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