オミクスデータの統計解析・バイオマーカー探索 受託サービス比較

行が分子、列が試料になっているCSVやExcelが手元にある状態から始まります。NGSデータ解析との違いは、渡すものと、やってもらうことです。あちらはFASTQなどの配列データを渡してマッピングや定量から始めますが、こちらは定量が済んだところから、群間で差があるかを検定し、多変量解析で全体の構造を見て、バイオマーカーの候補を絞るところが中心になります。価格より先に見たいのは、他社や自前で測ったデータだけを渡せるかどうかです。測定サービスのオプションとしてしか受けていない会社もあるので、ここで分かれます。つぎに、どこまでやってもらえるかです。検定とクラスタリングだけなのか、ネットワーク解析やROC・機械学習でのバイオマーカー探索まで踏み込むのかで、出てくるものが変わります。3つめは必要な反復数で、1群3検体を下回ると受けてもらえないことがあるため、実験を始める前に見ておきたいところです。