NGSデータ解析(DRY解析) 受託サービス比較
すでに読み終わったシーケンスデータを渡して、バイオインフォマティクス解析だけをやってもらうサービスです。
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NGSデータ解析(取得ずみのシーケンスデータを渡して、解析だけを頼む受託)
自分のところで読んだデータ、共同研究者からもらったデータ、公共データベースから落としたデータが対象になります。価格より先に見たいのは、どの解析に対応しているかです。バルクRNA-seqだけの会社と、WGS・WES・ATAC-seq・ChIP-seq・シングルセルまで横断する会社があります。つぎに、何を渡せるかです。FASTQから受ける会社が多いのですが、BAMやcount matrix、Cell Rangerの出力から受けてくれるところもあり、手元にあるものがそのまま渡せるかで手間が変わります。3つめは、あとから自分で再現できるかどうかです。解析スクリプトやパラメータの設定値をもらえれば、論文のMethodsが書けますし、査読で条件を変えて出し直すときも自分で回せます。図と表だけだと、そこで止まります。
比較条件を設定 条件を指定して、目的に合うサービスを探せます。 条件を閉じる 条件を開く
各社の公開情報から計算した参考価格です。正式な金額は各社の見積で確認してください。
税区分は各社の表記によります。
「起点」は基本料金に含まれる最初の工程です
(起点が違うと、同じ金額でも含まれる作業が違います)。
料金を公開していない会社も「要見積」として並べています。
表の見出しの文字を押すと、その列で並べ替えられます
(もう一度押すと逆の順)。
記載なしは、いつも最後に並びます。
登録企業は、受託解析Quick 上で見積に直接回答します(未登録の会社にも依頼できます)。
表は左右にスクロールして詳細を比較できます。
| 見積 | 会社・サービス | ランキング ▲ | 参考合計(6サンプル) | 基本料金(単価) | 製品の特徴 | 最低サンプル数 | 起点 | 解析できるデータ | 受け付ける入力 | やってもらえる解析 | 納品されるもの | あとから自分で再現するための情報 | 納期 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
キュービクス
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
データ解析のみの依頼も受けると明記
2
エクソームから16Sまで一つの窓口
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記載なし | 取得ずみのデータを送る | 全ゲノム・全エクソーム・ターゲットシーケンス(パネル)・メタゲノム・16S・バルクRNA-seq | 記載なし | 記載なし | 解析レポート・報告書・中間ファイル(BAM・VCF・RDSなど)・表(count・TPM・変動遺伝子のcsv) | 記載なし | 記載なし | |
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ユーロフィンジェノミクス
|
— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
クリーニングとQCからマッピングまで
2
発現量の比較や変異抽出まで
3
BAM・VCF・発現データを納品
|
記載なし | 取得ずみのデータを送る | バルクRNA-seq・全ゲノム・全エクソーム | 記載なし | データのQC・フィルタリング・リファレンスへのマッピング・発現量の定量(count・TPM)・変動遺伝子解析(群間比較)・変異検出(SNP・INDEL) | 中間ファイル(BAM・VCF・RDSなど)・表(count・TPM・変動遺伝子のcsv) | 記載なし | 記載なし | |
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Rhelixa
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
手元のFASTQを送れば解析だけ頼める
2
RNA-seqからATAC・メチル化まで横断
3
納期2〜5週
|
記載なし | 取得ずみのデータを送る | バルクRNA-seq・シングルセルRNA-seq・全ゲノム・全エクソーム・ATAC-seq・ChIP-seq・DNAメチル化(RRBS・WGBS・アレイ) | FASTQ | 次元削減・クラスタリング(PCA・UMAP)・変動遺伝子解析(群間比較)・GO・パスウェイ・GSEA | 記載なし | 記載なし | 2〜5週(RNA-seq・ATAC・ChIP・WGS・WESは2〜4週、シングルセルとRRBS・WGBSは3〜5週) | |
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KOTAIバイオテクノロジーズ
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
他施設で取ったデータも受ける
2
Visium HD・Xeniumにも対応
3
論文Methods用の文章例まで納品
|
記載なし | 取得ずみのデータを送る | シングルセルRNA-seq・空間トランスクリプトーム | 記載なし | データのQC・フィルタリング・次元削減・クラスタリング(PCA・UMAP)・細胞タイプのアノテーション・変動遺伝子解析(群間比較)・GO・パスウェイ・GSEA・擬似系譜(トラジェクトリ)・細胞間相互作用 | 解析レポート・報告書・図表(UMAP・volcano・ヒートマップなど)・中間ファイル(BAM・VCF・RDSなど) | 解析のパラメータ・設定値・論文Methods用の文章例 | 記載なし | |
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アメリエフ
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— | ¥1,680,000 税抜 | ¥280,000/サンプル |
1
報告会を2回おこなう
2
手法の解説と結果の解釈まで付き合う
3
データ解析だけで頼める
|
記載なし | 取得ずみのデータを送る | シングルセルRNA-seq | FASTQ・VCF | データのQC・フィルタリング・次元削減・クラスタリング(PCA・UMAP)・細胞タイプのアノテーション・変動遺伝子解析(群間比較)・GO・パスウェイ・GSEA・擬似系譜(トラジェクトリ) | 解析レポート・報告書・図表(UMAP・volcano・ヒートマップなど)・表(count・TPM・変動遺伝子のcsv) | 記載なし | 記載なし | |
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KOTAIバイオテクノロジーズ
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— | ¥30,000 税抜 | ¥5,000/サンプル |
1
FASTQを送るとQCからマッピングまで
2
変動遺伝子やエンリッチメントまで
3
ヒト・マウスは2週間
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記載なし | 取得ずみのデータを送る | バルクRNA-seq | FASTQ | データのQC・フィルタリング・リファレンスへのマッピング・発現量の定量(count・TPM)・次元削減・クラスタリング(PCA・UMAP)・変動遺伝子解析(群間比較)・GO・パスウェイ・GSEA | 図表(UMAP・volcano・ヒートマップなど)・表(count・TPM・変動遺伝子のcsv)・中間ファイル(BAM・VCF・RDSなど) | 解析のパラメータ・設定値 | 2週(ヒト・マウスの場合。ほかの生物種はリファレンスの確認と相談で日数が増えることがある) |
ランキングの決め方:受注数・見積依頼数・価格(参考合計)・見積返信の速さ・ユーザー評価から計算しています。 受注数・見積依頼数・返信の速さ・評価は、受託解析Quick 上での直近12か月の実績です(実績がまだない項目は0点)。 広告(PR)の出稿や手数料の額では変わりません。 くわしく