菌種同定(純粋培養株) 受託サービス比較
単離して純粋培養した菌株を送ると、rRNAの配列を読んでデータベースと照らし、近縁種を返してくれるサービスです。
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菌種同定(純粋培養した菌株のrRNA配列による同定)
混ざったままの試料を読む菌叢解析とは別のもので、どの会社も純粋培養された株であることを条件にしています。価格より先に見たいのは、どこまで読むかです。細菌の16Sは部分配列(約750 bp)でも属まで決まることが多いのですが、近縁種が多い属では種まで決まりません。全長(約1,500 bp)まで読むと分離能が上がります。真菌はITSが標準で、酵母では28S/26SのD1/D2も使われます。つぎに、何を送れるかです。シャーレのまま送れるのか、抽出ずみのDNAでないと受けてもらえないのかで手間が変わります。病原性の可能性がある菌は、菌体では受け付けずDNAにしてから送るよう求める会社が多いです。3つめは生データをもらえるかどうかで、波形(ab1)とつなげた配列(contig)があれば、あとから自分でBLASTをかけ直せますし、論文や菌株登録にも使えます。
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各社の公開情報から計算した参考価格です。正式な金額は各社の見積で確認してください。
税区分は各社の表記によります。
「起点」は基本料金に含まれる最初の工程です
(起点が違うと、同じ金額でも含まれる作業が違います)。
料金を公開していない会社も「要見積」として並べています。
表の見出しの文字を押すと、その列で並べ替えられます
(もう一度押すと逆の順)。
記載なしは、いつも最後に並びます。
登録企業は、受託解析Quick 上で見積に直接回答します(未登録の会社にも依頼できます)。
表は左右にスクロールして詳細を比較できます。
| 見積 | 会社・サービス | ランキング ▼ | 参考合計(3菌株) | 基本料金(単価) | 製品の特徴 | 最低菌株数 | 起点 | 対象の微生物 | 読む領域 | 読む長さ | 受け付ける形 | 納品されるもの | 納期 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
マクロジェン・ジャパン
|
|
¥26,400 税区分:一部記載なし | ¥8,800/菌株 |
1
シャーレのまま送れる
2
16Sは1,300 bp以上を保証
3
BLAST結果と簡易系統樹まで納品
|
記載なし | 菌株を送る | 細菌・カビ・酵母 | 16S rRNA(全長)・ITS(真菌・酵母)・28S/26S rRNA D1/D2 | 16Sは1,300 bp以上の配列データを保証 | 寒天培地(シャーレ)・グリセロールストック・抽出ずみのDNA | 波形データ(ab1)・つなげた配列(contig)・BLASTの結果・同定レポート・簡易系統樹 | 1〜3日(最短即日、遅くとも3日以内。20菌株以上は延びることがある) | |
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北海道システム・サイエンス
|
— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
細菌は16S・真菌はITSを両鎖で読む
2
日本薬局方の迅速同定法に基づく
3
波形とアセンブリまで納品
|
記載なし | 菌株を送る | 細菌・カビ | 16S rRNA(部分配列)・ITS(真菌・酵母) | 記載なし | 寒天培地(シャーレ)・菌体ペレット・抽出ずみのDNA | 波形データ(ab1)・つなげた配列(contig)・BLASTの結果・同定レポート | 記載なし | |
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GENEWIZ(アゼンタ)
|
— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
16SのV1からV9まで全領域を双方向で読む
2
真菌はITS-1とITS-2
3
シャーレやグリセロールストックでも受ける
|
記載なし | 菌株を送る | 細菌・カビ | 16S rRNA(全長)・ITS(真菌・酵母) | 16SはV1からV9までの全領域をカバー | 寒天培地(シャーレ)・菌体ペレット・グリセロールストック・抽出ずみのDNA | 波形データ(ab1)・つなげた配列(contig)・同定レポート | 記載なし | |
|
日鉄環境
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— | 要見積(基本料金が非公開) | 要見積 |
1
16Sは部分配列と全長を選べる
2
片鎖と両鎖も選べる
3
BSL2以上の菌体は不可
|
記載なし | 菌株を送る | 細菌・カビ | 16S rRNA(部分配列)・16S rRNA(全長)・ITS(真菌・酵母)・28S/26S rRNA D1/D2 | 16Sは部分配列が約750 bp、全長が約1,500 bp | 寒天培地(シャーレ)・スラント | 同定レポート | 記載なし |
ランキングの決め方:受注数・見積依頼数・価格(参考合計)・見積返信の速さ・ユーザー評価から計算しています。 受注数・見積依頼数・返信の速さ・評価は、受託解析Quick 上での直近12か月の実績です(実績がまだない項目は0点)。 広告(PR)の出稿や手数料の額では変わりません。 くわしく